同城内に勧請し創建されたと伝えられる。同所に湯島聖堂を中心とする昌平坂学問所を設立するにあたり、翌年現在地である本郷の富元山真光寺境内に再遷座している。1872(明治5)年11月に村社に列せられた。旧社殿は東山天皇の御代に造営され、1753(宝暦3)年に改築するなどし維持されてきたが空襲により焼失し、1959(昭和34)年9月再建された。本郷駅から極近い、春日通り沿いに鎮座している。地下鉄からであれば3番出口を出て、交差点にある交番に向かって春日通りを横断し左に向かえばすぐ。鳥居をくぐってすぐの左側には鶏が飼育されていた。御祭神は菅公一柱だけなのだが、神使は牛のはずで...それとはあんまり関係ないのか。拝殿右手奥に見送稲荷神社が鎮座する。