設立に伴い、九州地区全体の総轄組織をする目的で設立されました。2001年(平成13年)に九州東海大学(現・東海大学九州キャンパス)に専任事務局を設置し、2007年(平成19年)に日本文理大学に事務局が移転して現在に至っております。ち回りで大会を運営しておりましたが、リーグ戦化を目的として2010年(平成22年)秋季大会から2015年(平成27年)秋季大会まで、各地区で予選リーグを実施し、各地区上位2チームが決勝トーナメントを実施する方式で実施をしました。「北部九州ブロック大会」ならびに「南部九州ブロック大会」を開催することとなりました。学生野球は大学における課外活動の一環として、人間形成の一翼をにない、学生らしく、若々しく、最高学府で学ぶ学生として誇りと品位を忘れてはならないと思います。学生野球憲章にもあるように、学生であるという自覚を基礎として、勤勉と規律を重んじ、フェアの精神を体得して頂きたいと思います。