リアルタイムPCRシステムは、プレート上の総てのサンプルに対して均質かつ安定した熱伝導、熱分配を可能にしており従来までのリアルタイムPCRと比較して非常に優れたウェル間の温度均質性(最大ウェル間差0.4°C以下)をもっている。フラグメント上の配列多様性(例:SNPs、変異)の探索も可能である。高感度に検出できる方法として有用であるが、サイクル終盤に起こるプラトー効果などのため、定量には面倒な操作を必要する。用いることにより、PCR反応液中に混和しておいた蛍光物質が増幅産物に比例して増強する様子をサイクルごとにReal-Timeに検出することでPCR増幅産物の増幅曲線を描くことができる。得られた増幅曲線から指数増幅期のカイネティクス分析に基づき、初期鋳型DNAの量を推定することが可能となる。当機においては、filterを調節することにより、1つのチューブ中であっても多波長の蛍光色素を同時に検出することが可能でその応用範囲は広い。発現解析が実現している。