高いヒット率を示せます。(タンパク質‐リガンド分子ドッキングスコア・マトリクス)低分子リガンドと、182タンパク質に対する200万の低分子化合物のSievgeneによるドッキングスコア・マトリクスを提供します。selectDSIに使われます。このデータベースの入手先情報は、screening_packマニュアルに記載されています。screeningを行なうプログラムです。Ullmanの方法により、低分子リガンドの立体構造に基づいて、類似したサブ構造探索を行います。マトリクスの固有値に基づき、低分子リガンドの分子の類似性を解析します。Overlap分子動力学計算により、低分子リガンド同士の体積の重なりが最も大きくなるような配置を考えることによる、リガンド分子の類似性解析を行います。ToolsYYMMDD.tar.gzに梱包されています。overlap)法を使って、クエリー分子と重なりが大きい分子を探索するプログラムです。(リガンドの物性値予測ツール)回帰学習を用いた低分子化合物および中分子の物性値予測ツールです。coefficient)、溶解度(LogS)の予測値を計算します。(溶解度推定ツール)分子記述詞と溶媒和自由エネルギーに基づいて低分子化合物の溶解度(LogS)を推定し、アグリゲータも予測します。structureフラグメントベースのバーチャル化合物生成プログラムのソースコードです。このプログラムはフラグメントDB作成ツール、DBマージツール、構造生成ツールの3つの機能を提供しております。ReCGenは京都コンステラ・テクノロジーズが著作権を有する化合物構造生成プログラムです。予測するプログラムです。合成容易性は、0(簡単)~10(困難)の数字で表示されます。filesPDBが提供するPDBx/mmCIFフォーマットとPDBフォーマットの双方のデータの読み書きを行うライブラリを提供します。C言語、f77およびf90のプログラムとリンクさせ、それらから呼び出して使う事ができます。