タコパスクルーは「ズットマッテル」と体を震わせ答えた。偵察に向かうと、ルーンが機械につながれていた。ルーンを機械に繋ぐことで機能を制御しているようだ。ノア「呼んでる...。工場の奥へ進んでいくと、大きなクラゲの姿が見えた。ネモ「方舟だ」そこへ過去に助けようとしていた島の住人の医師が現れた。医師は仮の姿で、実際は研究チームの指揮官だった。大層な仕掛けて方舟を操ろうとしていた。指揮官はノアの島の人々を皆殺しにしていた。過去に助けようとした医師は指揮官だった現代~医師の目的~ネモ「お前たち連邦はいつもそうだ。小さな犠牲は止むを得ないと言いながら弱いものを殺す。医師「我々が仕えているのは、この世界の絶対的な法則というべきもの。あの方舟であらゆるものを滅ぼせば、彼はきっと喜んでくれる!」ネモは医師を殺そうとする。すると医師はネモに告げた。「あなただってこの方舟を求めていたのでしょう?艦長は帝国とたたかい、連邦を裏切った。連邦も帝国も何もかも滅ぼしてしまいましょう。あなたが守ったこの方舟で!」ネモは工場の施設を破壊していった。すると方舟が動き出した。方舟はすでに目覚めていた。すべてを喰らい永遠に生きている...。ネモはアルゴノート2を呼び出した。ネモが乗っていた機竜が変形し、ネモの義手と合体し巨大な砲身となる。医師は嘲笑いながら魔法防壁を張った。ネモの砲撃は施設の防壁とルーンによる障壁を貫いた。医師の立体映像は掻き消えた。方舟を破壊しようとするネモと止める者がいた。