Quest(裏)は本編クリア後にプレイ可能となる2周目ボーナスモード。ストーリーは本編と同じだが全てのマップが左右反転しておりダンジョンの仕掛けや黄金のスタルチュラの場所が全て変化している。ダンジョンの難易度が高くなり敵からのダメージが増加、シビアな操作テクニックが要求される。Quest(裏)デクの樹サマの中(裏)ドドンゴの洞窟(裏)ジャブジャブ様のお腹(裏)森の神殿(裏)炎の神殿(裏)氷の洞窟(裏)水の神殿(裏)井戸の底(裏)闇の神殿(裏)魂の神殿[子供](裏)魂の神殿[大人](裏)ガノン城内部(裏)[▲]「ゼルダ時のオカリナ3D」TOP(C)ゼルダの伝説時のオカリナ3D。