細胞の形の分析に取り組んでいるわけだが、バイオリンの形に関する分析の論文があったので読んでみた。以下は手法と解釈についてのメモ。数学的に厳密な理解までは手が届いていない。考えてそれらの関係を調べる。「形」はそのままだと扱えないので、数学の助けを借りないなら面積などでクラス分けしてカテゴリ変数にすることになりそう。(少し恣意的か?)バイオリンの画像は上から撮った写真を二値化したものを用いる。競売のためのもので、高級なものが多いなどの選択バイアスがありそう。まとまった指標を作る線形判別解析でクラス分けする階層クラスタリングで系統の有無を調べる主成分分析と線形判別解析の共通点としては、ひとまとまりにすることで次元を削減する点がある。他にも基底はありえるらしい。順序のある2つの変数の差を図る方法。順番のみに依存するノンパラメトリック手法。階層クラスタリング階層化クラスタリングは系統の分岐を調べてグループごとに解釈をするのに役立つ。Plateスプラインのプロット形の変化を目で見やすい(3次元以上は苦しそう)ボックスプロットその他ボックスプロットを複数並べるだけでも結構な情報量がある。メモはてなブログをはじめよう!kuyataさんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。