南西諸島などで固有種を含む多くの在来小動物を捕食、ヤマネコ類への病気伝播も。絶滅している可能性が高い。10-5月に北海道沿岸に回遊。冬から春に、銚子沖に至る近海沖合いに回遊。北極海周辺から、ごくまれに北海道・青森県に迷行。冬に北海道東部周辺に南下。日本で繁殖する唯一のアザラシ類。北海道東岸を中心に生息。冬に少数が北海道東部周辺に南下。冬に北海道東部周辺に南下。2002年「タマちゃん」が話題に。【海】北米西岸から稀に迷行。明確な記録は1989年に伊豆諸島新島に衰弱した雄(保護され、1996年まで鴨川シーワールドで飼育された)と2001年に館山市波左間で確認されたのみ。宮崎県串間市の都井岬と北海道根室支庁のユルリ島の2か所に、野生化したウマ(ノウマ)が棲息。前者はミサキウマ(御崎馬)と呼ばれる。ミサキウマおよびその繁殖地は天然記念物。亜種ではなく1種を立てるべきとの議論もある。亜種ではなく1種を立てるべきとの議論もある。イノシシとの雑種であるイノブタが各地でニホンイノシシと交雑。「日本の侵略的外来種ワースト100」に選定。奈良(奈良県奈良市一円)のシカは天然記念物。1600年代に薩摩(鹿児島県)から移入されたキュウシュウジカが島嶼の環境に適応して特異化したものとされる。農林資源への食害あり。個体数が少なく絶滅が危惧されるが、(国内)移入種としての側面を併せ持つためか、環境省レッドリストには記載がない。IUCNレッドリストではCR(絶滅寸前)、日本哺乳類学会のレッドリスト(1997年)では危急亜種。ケラマジカおよびその生息地は天然記念物。独立種とする説もある。環境省第4次レッドリストでは「馬毛島のニホンジカ」として絶滅のおそれのある地域個体群(環境省レッドリスト)に記載。観光用に放され和歌山県友ヶ島などで野生化。本土に渡れば在来亜種と交雑の恐れあり。1980年ごろ、房総半島で野生化。八丈小島・三宅島でも野生化。侵略的外来種ワースト100」に選定。1919年にトカラ列島の諏訪之瀬島から導入された日本在来牛が、同列島の口之島で野生化。口之島牛またはトカラ牛と呼ばれる。太平洋を回遊中に近海を通過するが、沿岸ではほぼ絶滅。夏に北上、オホーツク海や東シナ海に回遊。4-10月に見られる。現・カツオクジラが種として分離されるまで、「カツオクジラ」は本種の別称だった。【海】かつてはニタリクジラと同種とされた。春から初夏に三陸、夏に北海道沖やオホーツク海、日本海側では1年中。1998年に山口県角島で死体が発見され、2002年に新種として発表。小笠原諸島と南西諸島で繁殖、ベーリング海とカムチャツカ沖の餌場に回遊。北極圏周辺に生息、国内ではオホーツク海からの放浪個体が大阪湾に迷入した1例のみ。北海道などで化石は出土している。オホーツク海の個体群は絶滅危惧であり、数百頭程度。絶滅危惧であり、発見は極めて稀。奄美諸島などで見られることがある。北太平洋での全生息数は200頭以上だが、詳しい事は不明。沿岸部を南北に回遊、日本では春と秋に太平洋沿岸を通過するが、日本海側でも確認されている。東アジア沿岸の個体数の総数は130頭前後。三陸・熊野沖など大陸斜面のある深い海域に多い。日本近海に産する大型鯨類では最も豊富。宮城・石川県以南で漂着・観察例。日本では、熊野灘で比較的よく目撃される。2002年鹿児島県で座礁、世界初の全身確認例。日本海側での座礁例が多い。胃内にビニール等が発見され、座礁数増加との関係が考えられる。太平洋側で数例の座礁記録。国内では、沖縄以外ではまれ。数例の座礁記録以外に情報がない。夏に房総から三陸沖の大陸棚斜面海域に生息。北極海・オホーツク海周辺から、まれに近海に迷入。江戸時代に一度のみ、北極海周辺から、近海に迷入。8-11月に北海道東岸やオホーツク海南部で、2-3月に紀伊半島沖でよく見られる。太平洋側の外洋と沿岸部。【海】12世紀ごろに日本近海(北半球)では絶滅(環境省レッドリスト):。沖合いでよく見られる。まれに沖縄から銚子沖で捕獲、座礁。1874年以来、1952年に80年ぶりに再発見。日本海や太平洋岸の沖合いでよく見られる。北海道から九州の太平洋を回遊。マイルカの亜種とされていた。西日本に多く、伊勢湾や土佐湾などには定住群が存在。冬は紀伊半島以南、夏は北海道周辺まで、太平洋側に分布。過剰捕獲により、伊豆半島沖の個体群は壊滅。スジイルカ同様、伊豆半島沖では壊滅状態。冬は北九州以南の東シナ海、夏は北海道以南。【海】かつては、同じハンドウイルカ属に属するハンドウイルカ(バンドウイルカ)の亜種とされることもあった。小笠原諸島や伊豆諸島において、ホエールウォッチングや、ドルフィンスイムの多くの場合はハンドウイルカではなく、このミナミハンドウイルカである。5月ごろに東北沖でよく見られる。春と秋に見られ、銚子以北の太平洋側では夏に見られることも。三陸以南の太平洋、東シナ海に生息、夏には日本海にも。熱帯の外洋性、日本では漂着1例、捕獲2例。最新の1991年は和歌山県での群れの捕獲。小笠原ではさらに豊富。