マイメロディちゃんはかわいいウサギの女の子。平和な“マリーランド”で楽しく暮らしていたのだけれど、不良のクロミちゃんとバクくんの逃げる手伝いをした、と間違えられて、人間の世界へ行くことになってしまった。人間の世界“夢が丘市”では、普通の中学生の女の子、夢野歌ちゃんがバイオリンを上手く弾きたい!と夢見ていた。歌ちゃんの憧れの人、柊先輩は天才バイオリニスト。今度は、この柊先輩に狙いをつけたクロミちゃん達だったが、メロディ・ボゥを使いこなす先輩に圧倒されてしまう。夢野家にやってきたマイメロディちゃんは、人間の世界にやってきたいきさつを説明するのだが、その様子があまりにものんびりしているので、歌ちゃんは心配になってしまった。みんなで「このコを助けてあげよう!」と、決めるのだった。歌ちゃんのクラスメイトの山本くんは、ちょっぴり内気な男の子。写真の撮影が上手なことで有名だ。ホームページ制作の授業で、同じ班になった歌ちゃんは、山本くんに、憧れの柊先輩の写真を撮ってくれるように頼んだ。歌ちゃんの家のお隣には、ちょっと変わった人が住んでいる。お隣の飛田さんは、掃除をするのが大嫌いで、たくさんのゴミに囲まれて暮らすのが大好きなのだ。クロミちゃんは、この飛田さんに目をつけた。サッカー部の練習を見学した歌ちゃんたちは、そこで、キャプテンの内田先輩とマネージャーの高橋さんと知り合った。内田先輩は注目の選手なのだ。ある日、マリーランドからフラットくんがやってきた。マイメロディちゃんのことを心配するフラットくんは、クロミちゃんをつかまえに出かけよう!と提案した。つきあう歌ちゃんとマイメロディちゃんの前に、バイクに乗った老人が現れた。彼の名前は土方ジョージ。若い頃に渡せなかったラブレターを、初恋の女性に渡すために、夢ヶ丘市に帰ってきたのだ。歌ちゃんと美紀ちゃんは、柊先輩のことが大好き!美術の授業でも、柊先輩の似顔絵を描いて盛り上がっていた。いつも一緒の二人だけれど、その日は、美紀ちゃんだけが、柊先輩に声をかけられた。家においでよ、と誘われて有頂天になる美紀ちゃん。真菜ちゃんは、子供の頃に、かわいいもの好きな従妹のハルミちゃんに振り回されたせいで、かわいいものが苦手になってしまった。そのハルミちゃんとおばさんが来ると聞いて、げんなりしていた真菜ちゃんの前に、かわいいマイメロディちゃんが現れた。琴ちゃんのクラスでは“おおなわとび”の全国大会を目指して、練習に励んでいる。クラスの秀才、中沢くんはひっかかってばかり。中沢くんを責める太田くんと、中沢くんをかばう琴ちゃんで、ケンカになってしまう。奏お姉ちゃんは、美人でオシャレな高校生。そのくせに、ドキドキしすぎて上手く話しかけられない。マイメロディちゃんの小さな身体では何かと大変なことばかり。歌ちゃんのクラスメイト、白山くんはちょっと変わった男の子。ノラ猫に追われているところを、柊先輩に助けられたマイメロディちゃん。先輩はお家まで送りとどけてくれた。小暮くんは陸上部で短距離走の選手を目指してがんばっている。背の高い先輩たちには勝てなくて、いつも補欠選手。気にしていないふりをしているけれど、ほんとは、すごく悔しいのだ。ある日、歌ちゃんをからかっていたら、逆にそのことを指摘されて、うろたえてしまう。お父さんの部屋をそうじしていた歌ちゃんとマイメロディちゃんは、ふとしたはずみで、お父さんのレコードプレイヤーを壊してしまった。電気屋さんでは直せないと言われて、骨董街のレコード屋さんを紹介された。ところが、そこの店長さんはとんでもない偏屈者で、追い出されそうになってしまう。そこに現れたのは、有名な二枚目俳優、松本ヨーイチだった。柊先輩のメールアドレスをゲットした歌ちゃん。マイメロディちゃんのおかげで、なんとかメールを送ることができた。いうのも、お父さんと海に行く約束していたから。ところが、お父さんに仕事の電話がかかってきてしまった。琴ちゃんは悲しくて怒ってしまう。夢野家のみんなは海にやってきた。マイメロディちゃんとフラットくんも、海で遊んで大喜び。歌ちゃんたちは柊先輩の別荘に招待された。夢みたいな生活にウットリする歌ちゃん。この島には“流星を一緒に見た人とずっと一緒にいられる”という不思議な伝説があるらしい。クロミノートを読み返していたら、腹が立ってきたクロミちゃん。八百屋さんの権蔵さんと仲良くなったマイメロディちゃんは、はじめて一人でおつかいに行くことにした。いつものようにパラソルで飛んでいると、強い風が吹いて、落っこちてしまった。今日は柊先輩のお屋敷でパーティーが開かれる。クロミちゃんは柊先輩と踊るつもりで、ウキウキとダンスの練習をしていた。今日は学校で授業参観がある。歌ちゃんは、お父さんがいつも変な格好をして来るのでちょっぴり憂鬱だった。ところが、クラスにはもっと憂鬱なコがいた。歌ちゃんのクラスの委員長、駒鳥つくねちゃんはちょっぴりドジな女の子。無理をしてがんばりすぎてしまうから、ますます失敗ばかり。今日も、頼まれたことを一人で全部引き受けて、焦ったせいで転んでしまい、資料を整理するはずが逆に散らかしてしまった。そこに現れたのが、マイメロディちゃん。真菜ちゃんが格闘技のコーチをしているジムを見学していた歌ちゃんは、そこでなぜか、妹の琴ちゃんを目撃した。して、琴ちゃんがジムに?実は琴ちゃんのボーイフレンドの太田くんが格闘技を習っていたのだ。おまけにいじめっこで強くて有名な、ライバルジムのヤマトくんとの対戦をひかえて特訓中だった。歌ちゃんのクラスの有働くんは、背が高くて身体が大きいのに、気弱な自分にコンプレックスを抱いていた。マイメロディちゃんの故郷、マリーランドでは異変がおこっていた。お城のゴルフコースのバンカーが、大きくなってしまったようなのだ。王様がパワーアップの秘術を施すために、人間界へと向かった。歌ちゃんと小暮くんはいつもケンカばかり。ホントは・・・好きだったりして!?クラスの女の子たちにからかわれた小暮くんはムキになって否定してしまう。小暮くんは、スタイルが良くて美人の女の子、が理想だと言い張った。そこに現れたのは、クラスで一番の美人、宮前貴子ちゃんだった。最近の音楽部は活気がなくて、永代橋先生は困っている。柊先輩が部活に来てくれないので女の子たちがサボるようになってしまったのだ。