1966年(昭和41年)9月1日:東武伊勢崎線への乗り入れ区間を北春日部駅まで延長。終日6両編成での運転を開始[3]。不燃化対策が強化される。1970年(昭和45年)7月:ラインカラーを導入(日比谷線はシルバー)。それ以前は路線図において紫色で表示されていた[4]。1971年(昭和46年)5月31日:終日8両編成での運転を開始。1972年(昭和47年)11月21日:広尾駅で車両火災。1981年(昭和56年)3月16日:東武伊勢崎線への乗り入れ区間を東武動物公園駅まで延長。東武20000系・東急1000系の営業運転もそれぞれ開始され、3事業者揃って新型車両への代替が始まる。8月9日:東急東横線日吉駅の改良工事に伴って同駅南側(桜木町方)の引き上げ線が一時的に撤去されるのに伴い、東横線への乗り入れ区間を菊名駅まで延長。1990年(平成2年)9月17日:03系5扉試作車の営業運転を開始。1991年(平成3年)11月:東急東横線日吉駅の改良工事完成に伴い、東横線への乗り入れ区間を日中のみ日吉駅までに変更し、菊名駅への乗り入れは朝夕ラッシュ時のみとなる。1992年(平成4年)6月16日:中目黒駅引上線で衝突事故発生。1994年(平成6年)7月23日:3000系車両が引退。1995年(平成7年)3月20日:地下鉄サリン事件発生。営団路線の中で最も大きな被害が発生し、終日運休となった。北千住駅の改良工事の大部分が完成し、日比谷線の発着は1階の東武線ホームから3階のホームに分離される(全体の完成は1997年3月)。霞ケ関駅間で往復運行される(なお、千代田線や有楽町線でも同様のイベントが同時に行われた)。)発生、5人が死亡した。営団時代に発生した事故の中で唯一、乗客に死者が出た事故である。北越谷駅間の複々線化工事完成および東急東横線の「特急」運転開始に伴うダイヤ改正を実施。ルートに転移していることなどから、東横線との相互直通列車の本数が削減される。きの南栗橋駅始発列車が朝に1本のみ設定される。10月18日:開業以来使用していたWS-ATCを新CS-ATCに切り換え、ダイヤ改正を実施[5]。最高速度を70km/hから80km/hに引き上げ[6]、一部区間で所要時分が変更。民営化し、東京地下鉄(東京メトロ)になる。2006年(平成18年)3月27日:平日7時30分から9時まで北千住駅を発車する中目黒方面行き(東武伊勢崎線からの直通列車を含む)で女性専用車を導入した。運用は中目黒までで、9時の時点で一斉終了となる。高架化に伴い、元住吉検車区に出・入庫する全列車が元住吉発着から武蔵小杉駅発着に変更となる。2007年(平成19年)8月23日:東急東横線のダイヤ改正で2008年6月22日の目黒線延伸による工事の関係上日吉駅の2・3番ホームが一時使用停止となったため、日中の日吉駅発着列車を菊名駅発着に変更する。よる発電所の停止に伴う電力供給逼迫のため、東京電力が輪番停電(計画停電)を実施。相互直通運転が休止される。3月28日:東武伊勢崎線との相互直通運転が全面的に再開される。4月25日:東急東横線との相互直通運転が平日の朝・夕ラッシュ時のみ再開される。東急東横線との相互直通運転が全面的に再開される。2013年(平成25年)3月16日:東急東横線と副都心線との直通運転開始に合わせ、東横線と日比谷線との相互直通運転を終了し、中目黒駅までの運転となる[7][8]。