結婚式に参列するため、コリニー提督をはじめとする多数のユグノー貴族がパリに滞在していた。式の3日後、コリニー提督がルーヴル宮から宿へ帰る途中で銃撃を受け、手と腕を負傷した[95]。コリニー提督は宿舎へ運び込まれ、外科医アンブロワーズ・パレが肘から弾丸を摘出して負傷した指を切断した。カトリーヌは無感動にこの知らせを受け取るとコリニー提督を訪ねて涙を流し、犯人を罰すると約束した。真実が何れにあったにせよ、その後の流血事件はカトリーヌやその他の指導者たちの統制を超えるものとなった[97]。この2日後の8月24日(サン・バルテルミの祝日)、ギーズ公に率いられた兵士の一団がコリニー提督を襲撃殺害した。これを契機に民衆暴動が起き、兵士とカトリック市民がユグノー貴族だけでなくプロテスタント市民をも大量虐殺する事態へと発展する。このサン・バルテルミの虐殺はカトリーヌの評判を大きく傷つけることになった[47]。