比較的急傾斜地が多く、天塩川水系の大小山地河川(天塩川支流)が流れている。河川で魚類相やその個体数を調査し、治山ダム等の河川工作物が魚類の上流への移動を阻害して魚類分布に影響を及ぼしていることを指摘した。上川総合振興局)によって3基の治山ダム(下流側から第1-3治山ダム)が設置されている。よって琴平川流域を縦断するルートで建設が進められている(2007年度着工、2018年度併用開始予定)。関連して、当研究林は上川支庁に対して、魚類の移動確保等、本来の川の機能回復を要望した。その結果、第1、2治山ダムにはそれぞれ魚道が新設され、2013年度に第3治山ダムはスリット化された。このような河川工作物の改良が行われた場合、生態系に対する効果を検証することが重要である。