永正9年(1512年)に暦博士、永正11年(1514年)に兼任して陰陽頭に任命された。以後、左馬頭や宮内卿なども兼務しながら、陰陽頭を大永2年(1522年)、暦博士を天文2年(1533年)まで務めた。この間の享禄4年(1531年)には従三位に昇る。大永2年より天文6年(1537年)まで宮内卿を務め、陰陽師としてだけでなく後奈良天皇の側近としても活躍した。この功績によって天文5年(1536年)には従二位、更に天文20年(1551年)にはこの家系では初めて正二位に昇進した。この時期に北条氏綱を頼って相模国に下ったものの、天文11年(1542年)に所領の若狭国名田庄に退いて陰陽頭としての職務を行わない土御門有脩に代わって陰陽頭の職務を代行するために呼び戻された。天文22年(1553年)9月22日には、在富の妻が山科言継の三男・鶴松丸(のちの薄諸光)を養子にしたいと要請したが、断られている[5][2]。その前後には山科言継との関係は良好であり、親密な関係があった[6]。唯一の息子である賀茂在昌は、永禄2年(1559年)、ガスパル・ヴィレラらの上洛の折にキリシタンとなり[7]、永禄7年(1564年)には妻子を連れて京を出奔して、西洋天文学を学ぶため豊後府内に留学した[8]。在富は後継者が不在のまま、翌永禄8年(1565年)8月10日死去。土御門有春の子である在高を[9]、さらにその没後は続いて土御門有脩の子である土御門久脩(勘解由小路在綱として改姓改名)を養子に入れて[10]辛うじて存続したものの衰退。息子と思われる勘解由小路在信[11]の代に至って消息不明となり断絶した。実質絶家したものと見なされることが多い。勘解由小路家の通字「在」は「あき」と読むのが正しいとされる[1]。『尊卑分脈』にある「父卿殺害之」という記述[3]の「父」とは、養父在富ではなく、実父在種を指す可能性も指摘されている[4]。立教大学、1965年。doi:10.14992/00001009。110009393982。吉川弘文館、1985年。4642026126。4626017983。2019年10月6日閲覧。4827310572。(日時は個人設定で未設定ならばUTC)。表示-継承ライセンスの下で利用可能です。追加の条件が適用される場合があります。詳細は利用規約を参照してください。Cookieに関する声明モバイルビュ。