白黒の画像にも「モノクロ2階調」と「グレースケール」といったモードがあるように、赤や青や黄色といった様々な色を使用したカラーイラストにも、いくつかのモードが用意されています。「インデックスカラー」は最大256色の色を使用できる描画モードで、色は自分で選択して用意するか、ツールにいまある画像を256色まで自動で減色してもらったり。拡張子GIFやPNGといった、小さいけどかっきりした画像保存形式などに使用されます。