IDに対応付けられる場合がある(Unigeneでは分かれていたクラスターが同じ遺伝子に対応付けられる場合がある)。IDは同じだが、その由来(ESTの発現データ)が異なるため、それぞれを区別して表示できるようにする。IDが異なるデータは違うレコードとして扱うようにする。IDが対応付けられる場合があるが、これについては、すべての対応を保持する。IDのみ異なる複数のレコードが生成される場合がある。IDにIDの変換を行う。IDが対応付けられる場合があるが、これについては、すべての対応を保持する。対応表を用いてIDの変換を行う。IDのみ異なる複数のレコードが生成される場合があるが、これは許容する。対応表を用いてIDの変換を行う。IDでオーソログ対応の対応表が得られる。IDをキーとして各遺伝子にオーソログ対応のアノテーションを行う。IDへの変換は、BioMartを用いて取得したIDの対応表を用いて行う。IDが対応付けられる場合があるが、これについては、すべての対応を保持する。データレコードの生成RefExの検索対象となる発現データのレコードは、上記ルールに基づき統合した場合、以下のように生成されたデータレコードセットと同じになる。