Babel本体は「変換する機能」を提供するもので、実際になにをどう変換するかはpresetがその作業を担っています。いえば、Babel公式チュートリアルは最後まで進めないとその「変換」をしません。これでBabelの準備ができたけど、実はまだ、何もしてないです。出力先ファイルを指定できるんですけど、そちらは事前にディレクトリを用意しておかないとエラーになります。‘out/app.js’一部新記法が変換されないよ、SyntaxErrorになるよ必要なpresetがないかも。definedpolyfillがないかも。変換されないんですがそれBabelの仕事じゃないです。WebpackやBrowserify等が必要です。変換されるだけみたいなので、やっぱり別途ツールが必要。変換ついでにminifyしたいBabel公式のminifierがありますのでそちらをどうぞ。babel-preset-envenvの方で良さそう。