花穂には3~10個の頭花がつき、頭花には3~6個の花がつく。花被片は長さ3~4mm、緑色、3個の外花被片、3個の内花被片があり、先が鋭くとがる。内花被片の方がやや長い。蒴果は長さ約5mm、褐色を帯び、花被片よりやや長く、形は楕円形~3綾状柱形など変化が多い。種子は長さ約0.5mmの倒卵形、表面に浅い格子状の模様があり、褐色になる。アオコウガイゼキショウも茎の断面が円形であるが、花が2~3個ずつしかつかない。蒴果が花被片の2倍ほどに長いことが多い。コウガイゼキショウは茎が扁平で、翼がある。