ように同種の原子が結合している場合では、共有電子対は両方の原子核の周りに均等に分布し、共有電子対がどちらかの原子に片寄って存在することはない。molecule)という。次に示したものは、Chimeを利用して表示した水素分子の分子模型(分子表面を表示してある)である。マウスの左ボタンをドラッグさせて回転させることができ、原子の透視ボタンを押すと、原子どうしの結合の様子も表示させることができる。マウスの右ボタンをクリックさせると、様々な表示が可能である。場合は、共有電子対は陰性の強い(電気陰性度の大きな)Cl原子の方にいくらか引き寄せられるので、Clの原子核の周りの共有電子対の存在密度が大きくなる。この結果、H原子はいくらか正の電荷(いくぶん正の電荷を帯びていることをδ+で表す)を帯び、Cl原子はいくらか負の電荷(いくぶん負の電荷を帯びていることをδ-で表す)を帯びることになり、分子内で電荷の偏りが生じることになる。molecule)という。極性分子の例として、塩化水素と水及びアンモニアをChimeを利用して表示させた。on|offここで注意しなければならないことは部分的に分極していても(極性が生じても)、分子全体では極性がうち消され、無極性分子になっているものがあるということである。(直線分子)では、CとOの間では分極している(極性が見られる)が、この2つの極性が互いに打ち消し合うので、分子全体としては分極が見られなくなる。従って、二酸化炭素は無極性分子である。部分的に分極があっても、分子全体として極性が相殺される分子、即ち正の電荷の重心と負の電荷の重心が一致するような分子は、無極性分子である。部分的には分極しているが、全体として無極性分子になっている例として、二酸化炭素(直線形の分子)とメタン(正四面体形の分子)、フッ化ホウ素(正三角形の分子)の例をChimeにより下に表示した。on|off因みに、次に示されるベンゼン(C6H6)も、全ての原子が同一平面上にあるので、個々のC−H結合は分極しているが、全体としては無極性分子となる。