ゲノム刷り込みの観点からiPS細胞を評価するため、マウス・ヒトiPS細胞、刷り込み疾患Beckwith-Wiedemann症候群(BWS)患者由来iPS細胞、肝芽細胞を発生母地とする肝芽腫について、刷り込み関連メチル化可変領域(DMR)の網羅的DNAメチル化を解析した。マウスではiPS化すると大半のDMRが低メチル化すること、一部の刷り込みDMRは分化誘導により正常メチル化に回復することがわかった。ヒトiPS細胞では、特定のDMRで父性パターン(父性エピジェノタイプ)へのメチル化変化が生じることが示唆された。肝芽腫では、一部のDMRのメチル化は腫瘍化に先立って起こる可能性が示唆された。