replyPythonのWebフレームワークであるDjangoについての忘備録。最新のリリースバージョンは2.1.7となっています。(2019年3月3日現在)https://www.djangoproject.com開発環境のセットアップ初めに、Pythonの開発環境を作成します。プロジェクトのフォルダを作成し、フォルダ内のPythonのバージョンを3.7.0に設定します。開発環境をenvフォルダ内に作成し、activateして開発環境を有効にします。pipDjangoプロジェクトDjangoプロジェクトの構造リポジトリのディレクトリに移動し、django-adminコマンド(またはdjango-admin.py)を使用して、プロジェクトを作成します。<プロジェクト名>その後、プロジェクトのディレクトリに移動し、同様にアプリを作成します。<アプリ名>結果として、以下のような階層構造となります。プロジェクトに関連するすべてのPythonコードの格納先。Djangoの各Appはこの階層に作成する。(configディレクトリ)Djangoアプリの設計いくつか用語の定義をしておきます。Djangoウェブフレームワークによって構成されるウェブアプリケーションのこと。プロジェクト内の小さなライブラリ群のこと。appsで構成されます。それらのアプリのうち、いくつかはプロジェクトの内部で使用されるだけで、再利用されません。その他、サードパーティのDjangoパッケージなどもこれに含まれます。appsのリストのこと。スクリプト言語と呼ばれるプログラミング言語です。スクリプト言語にはTclの他にも様々な言語があります。スクリプト言語を使用すると、ある作業を自動化したり、繰り返すことが求められるタスクを管理したりすることができます。Tclコマンドコマンドまず注意すべきことは、Tclでは、大文字と小文字を区別する点です(Setとsetは異なるものとして扱われます)。基本的な文法としては、コマンド、空白スペース、引数といった形でタイプします。簡単なサンプルを実行してみます。以下を入力してエンターキーを押します。World”を渡しています。Worldと出力されます。コマンドはセミコロン(;)をつけることでコマンドの終端を表現できます。これによって、一行に複数のコマンドを書くこともできます。World2上の文の結果は、以下のように1文ずつ実行した場合と同義です。World2コメントコマンドは実際に実行されるものですが、メモとしてコメント(comment)を記述することもできます。コメントを記述する場合は、文頭に文字#を使用します。変数の定義Tclでは変数(variable)を定義できます。変数では、ある状態またはある値を保持し表現できます。ある変数を定義するためには、setコマンドを使用して、以下のように定義します。setコマンドには、変数に格納する値としてただひとつの引数を与えます。引数に空白スペースが含まれる場合は、ダブルクォーテーション(“)または中括弧({})で値を囲みます。定義した変数を引用するためには、定義した変数名の頭に$記号をつけます。$myVar標準出力には、先ほど変数を定義したときに代入されていた値が表示されます。(CLEM)とは、蛍光顕微鏡と電子顕微鏡の観察を組み合わせた解析方法です。蛍光顕微鏡で観察した部分と同じ場所を電子顕微鏡で観察し、それぞれの方法で取得した画像を比較して相関をとることによって、分子特異的な局在を解析する手法です。はじめに細胞のダイナミックな振る舞いは、細胞内の高分子複合体同士の相互作用の結果です。核酸、タンパク質、代謝生成物やイオンのライブセルイメージングと高解像による特定は、細胞の一部分から分子レベルで行うことが可能で、複雑な細胞内の機能を理解するために必要な重要な情報を明らかにします。situで分子を特定することに成功しています。分子生物学の遺伝子組み換え手法と合成化学の発展で、新しいプローブと標識技術が誕生しました。中に含まれる機能的な複合体を形成する高分子の集合体の構造とダイナミクスに関する新しい知識を得るための画像化の範囲です。(語源となったギリシャ語の”mesos”は中位という意味です。)メゾスケールの構造は、光学顕微鏡を使用して画像化され、より詳細な構造を捉えるために電子顕微鏡を使用して画像化されます。これは多数の予備的な手法とともに行われます。2006]などもあります。なるタンパク質をハイライトするひとつの方法は、それらのタンパク質にプローブ(probe)を付けることです。2006]、ペルオキシダーゼ媒介沈殿物のような非蛍光染色が含まれます。電子顕微鏡マーカーは、背景成分から区別を行うために、高い電子密度である必要があります。ある構成要素に対してラベリングを行った電子顕微鏡のトモグラフィーによる再構築の組み合わせは、細胞要素の中におけるタンパク質の位置を特定するために強力な手法となります。CLEMの応用事例は、細胞生物学の構造的基盤に対する我々の理解を革新します。対象とする特定のタンパク質をハイライトするために蛍光プローブが開発されています。よい蛍光顕微鏡装置はこれらのプローブを3次元または4次元(リアルタイム)でモニタリングできます。蛍光顕微鏡における発展は、タンパク質の共局在(colocalization)、ターンオーバー(turnover)、機能を決定するために役立ちます。蛍光顕微鏡の解像度での画像化は、プローブの一般的な細胞内での位置、サイズと形状、シーケンシャルなデータ取得のあいだのプローブの動きの程度だけしかわかりません。