DECK−マリク編−2003年12月11日発売。新規カードとして《収縮》を収録。原作で海馬が使用したカードを中心に収録されている。モンスター同士の戦闘で重要なアドバンテージ要素である《収縮》も、再録されるまで長らくここでしか手に入らなかった。他にも《大嵐》や《リビングデッドの呼び声》等の必須カードが多く再録されている。《XYZ−ドラゴン・キャノン》はストラクチャーデッキのトップに置かれ、イラスト変更での再録となった。ユニオンの降臨を中心に、レアリティが高く入手に苦労しやすかったカードの再録は嬉しいところ。原作にもアニメに一切登場しなかったためか、XZとYZは収録されていない。《デビル・フランケン》と《幻想召喚師》が収録されているが、その効果で特殊召喚できる融合モンスターが1枚も収録されていない。今回を最後に8年後のストラクチャーデッキ−ドラゴニック・レギオン−まで、ウルトラレアの2枚体制が見られなくなった。同時に、ストラクチャーデッキ−青眼龍轟臨−登場までの9年半、メインデッキ以外のカードも封入されなくなった。発売当時の制限カードは《同族感染ウィルス》・《大嵐》・《リビングデッドの呼び声》・《破壊輪》の4枚。