成果発表について(支援依頼者のかたへ)支援結果を含む論文等の成果を発表された場合は、速やかに支援事務局までご連絡下さい。プレスリリースをされた場合はURLも併せてご連絡下さい。論文発表に際しては、「先進ゲノム支援」の支援を受けている事を記載して下さい。Acknowledgementsに以下のように記載下さい。旧「ゲノム支援」の成果を発表される際は、旧「ゲノム支援」の課題番号「221S0002」を記載して下さい。旧「ゲノム支援」と「先進ゲノム支援」の両方の支援を受け区別が難しい場合は、論文には旧「ゲノム支援」の課題番号221S0002、「先進ゲノム支援」の課題番号16H06279の両方の記載をお願いします。支援を受けた課題では、支援依頼者に成果報告書の提出を毎年度お願いしています。ご協力をお願い致します。<補足事項>(2020年度公募要項より抜粋)支援担当者の関与の度合いにより、共著者とする共同研究の形や謝辞に記載する形等、必要に応じ事務局も交えて協議の上、適切な対応をお願いします。高度かつチャレンジングな課題については、申請者との協働作業が必須ですので、基本的に支援担当者との共同研究として進めたいと考えます。本支援活動では情報解析人材育成が特に重要視されています。情報解析は多大な手間がかかりますので、情報解析支援メンバーによる支援は共同研究の形でお願いします。ロゴデータのダウンロード「先進ゲノム支援」の支援を受けた研究成果を学会、Web等で発表される際には、こちらのロゴマークをダウンロードしてお使いください。先進ゲノム支援(PAGS)ロゴ圧縮データ(zip:300KB)プレスリリース一覧2016年以降、事務局にご報告頂いたプレスリリースを掲載しています。「先進ゲノム支援」での支援成果論文以外に、旧「ゲノム支援」の成果論文、班員による成果論文も含まれています。erecta)のゲノムを解読しました。Journalに1月24日にオンライン公開されました。小西裕之教授(特任)、兵頭寿典講師らの研究グループは,高いDNA配列書き換え効率を維持しつつ、書き換えエラーの発生を劇的に抑えるゲノム編集方法の研究を行いました。Reports」(電子版)に掲載され、愛知医科大学よりプレスリリースされました。RNA(ncRNA)を骨格として作られる細胞内構造体の核内ストレス体(nSB)の新機能解明に成功しました。誌にオンライン掲載され、北海道大学よりプレスリリースされました。働きや異なる栄養バランスへの適応能力が違うことを明らかにしました。Reports」のオンライン版に掲載されました。永野惇准教授、および国立遺伝学研究所の豊田敦特任教授らの共同研究チームは、インドネシアのスラウェシ島の古代湖に生息する3種のメダカが、1つの湖の中で同所的に3種に分化したことを明らかにしました。この研究成果は、進化学の国際学術雑誌「Evolution」誌のオンライン版に掲載され(2019年8月28日)、プレスリリースされました。有村慎一准教授らの研究グループは、ゲノム編集技術TALENによって、これまで不可能とされてきた植物のミトコンドリアゲノム(DNA)に存在する遺伝子を壊すことに成功しました。プレスリリースされました。らと共同で、カイコゲノムの新アセンブリを論文公開しました。Mb、残存ギャップ30個と、ほぼ染色体レベルで全ゲノムをカバーしており、16,880個の遺伝子モデルを含んでいます。アセンブリ配列はsilkbase(http://silkbase.ab.a.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/download.cgi)からダウンロード可能で、カイコのみならず昆虫研究の全般に寄与することが期待されます。revoluta)の花の発熱を、世界で初めてサーモグラフィーで捉えることに成功しました。Physiology誌の2019年6月号(米国東部時間2019年6月3日公開)にオンラインで掲載され、同雑誌の表紙を飾りました。国立遺伝学研究所の石川麻乃助教と北野潤教授らの国際共同研究チームは、進化生物学のモデル生物であるトゲウオを用いて、魚が海から淡水域へ進出する際に鍵となった遺伝子を発見しました。窪川かおる特任教授らと共同で、真核生物のゲノム配列決定において、両親由来の配列を区別し、高精度にそれぞれを決定する、新しい情報解析手法の開発に成功しました。プレスリリースされました。金弘渊大学院生と藤原晴彦教授らは、アゲハチョウ幼虫の擬態紋様の変化を制御する遺伝子を発見しました。Advances」オンラインジャーナルに掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。(矯正歯科学分野)と東海大学の岡晃講師および東京大学の三井純特任准教授らの研究グループは、次世代シークエンサーを用いたエクソーム解析により、カルシウム依存性陰イオンチャネルを塩基配列として持つBEST3遺伝子のヘテロ接合性変異が骨格性下顎前突症(下あごが上あごより前に出る噛み合わせ)の原因遺伝子の一つであることを発見しました。この研究は2019年3月に米国の科学雑誌「Bone」に掲載されました。共同で、がん免疫や病原体に対する感染防御に重要な樹状細胞の新たな産生経路と分化制御の分子メカニズムを明らかにしました。この成果は2019年2月23日に「Blood」オンライン版に掲載され、横浜市立大学からプレスリリースされました。教授(遺伝統計学)らの研究グループは、次世代シークエンス技術と機械学習を用いて、日本人集団における白血球の血液型が11パターンで構成されており、その個人差が、病気や量的形質を含む50以上の表現型に関わっていることを明らかにしました。Genetics」に、1月29日(火)午前1時(日本時間)に公開され、大阪大学からプレスリリースされました。豊教授らの研究グループは,餌を貯蔵しながら冬眠する哺乳類シリアンハムスターが,冬眠時,エネルギーを蓄える機能をもつ白色脂肪組織において,脂肪を合成する同化系と分解する異化系の両方を著しく増強させることを解明しました。Physiology」にオンライン公開され、北海道大学よりプレスリリースされました。共同研究チームは、第3世代シーケンサーと呼ばれる1分子DNAシーケンサーを活用することで、環境細菌叢のDNAメチル化修飾を観測する新たな手法「メタエピゲノム解析」を提唱し、その有効性を実証しました。Communications」(1月11日付オンライン版)に掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。らの研究グループは、マウス大脳の神経幹細胞を用い、組織幹細胞が特定の細胞だけを生み出せる機構のひとつを明らかにしました。ポリコーム群タンパク質の制御によって、神経幹細胞におけるニューロン分化能等の「幹細胞の操作」が可能になれば、将来再生医療に貢献することが期待されます。Cell」に掲載され、東京大学、AMEDからプレスリリースされました。共同で、植物における精子の形成が、約7億年前に陸上植物の祖先にあたる藻類でおこった新しい遺伝子(DUO1)の獲得により始まったことを明らかにしました。Communications」のオンライン版に掲載され、京都大学からプレスリリースされました。(常勤)らの研究グループは、ゲノム中のセントロメアを含む領域が細胞核内でどのように配置されているかを世界で初めて明らかにしました。Biology」に、2018年11月5日に掲載されました。伊藤武彦教授が中心の研究グループは、115種におよぶ生物種の全ゲノム配列を網羅的に解析して、ほぼ全ての脊椎動物が共有する極めて珍しいタイプのフェロモン受容体遺伝子を発見しました。Evolution』に掲載され、東京工業大学よりプレスリリースされました。豊田敦特任教授らのグループ、東京大学の鈴木穣教授らのグループからなる共同研究チームにより、テントウムシの多様な翅の斑紋(模様)を決定する遺伝子の特定に成功しました。辻村太郎特任助教らは、最先端のゲノム編集技術を用いて、CTCFと呼ばれるタンパク質が、ゲノムDNAへのある特定の結合パターンに従って、DNAの三次元構造を多層的に制御する機構を詳細に解明しました。Chromatin」に2018年9月14日に掲載され(*)、慶應義塾大学からプレスリリースされました。和多和宏准教授らの研究グループは,小鳥の音声発声学習(歌学習)に適した時期(学習臨界期)が,発声練習の経験量によって制御されていることを明らかにしました。掲載され、北海道大学からプレスリリースされました。らの共同研究グループは、卵巣子宮内膜症と正常子宮内膜の網羅的な遺伝子解析を行い、癌に関連する遺伝子変異がすでに良性腫瘍や正常組織に起きていることを明らかにしました。Reportsに2018年8月15日に掲載され、新潟大学からプレスリリースされました。RNA分解酵素が、寿命や温度耐性、産卵数や神経シナプスの刈り込み注1)など、多様な生命現象に関与していることを線虫の解析から明らかにしました。USA(PNAS)」に掲載され、甲南大学からプレスリリースされました。Rensing教授らの国際共同研究グループは、シャジクモの概要ゲノムを解読し、他の藻類および陸上植物との比較により、シャジクモの系統と陸上植物の系統の分岐前後における遺伝子レベルの進化の一端を明らかにしました。本研究成果は、2018年7月12日に米国学術雑誌「Cell」のオンライン版に掲載されるとともに、本研究に関する画像が「Cell」の表紙を飾りました。シャジクモのゲノム配列はDDBJより公開されました。個体のゲノム解析を実施し,今日の東南アジアで生活する人々の起源と過去の拡散過程を解明しました。今回,ゲノム解読がなされた縄文人骨は,愛知県田原市の伊川津(いかわづ)貝塚遺跡から出土した約2500年前の縄文晩期の女性人骨で,縄文人の全ゲノム配列を解読した例としては世界で初めての公表となります。本研究成果は,2018年7月6日に国際学術誌「Science」に掲載され、金沢大学よりプレスリリースされました。(博士課程3年)、程久美子准教授らの研究グループは、これまで細胞内ウイルスセンサーのひとつであるとされながらも機能が不明であった「LGP2」というタンパク質が、遺伝子発現の制御機構であるRNAサイレンシングを促進する「TRBP」というタンパク質と相互作用することで、TRBPが結合する特定のマイクロRNA群の機能を制御することを明らかにしました。Research(オンライン版:6月25日)に掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。NEAT1に潜むRNA暗号の解明に成功しました。Cell誌に掲載され、北海道大学よりプレスリリースされました。はがして子宮内膜間質を露出させ胚が子宮内膜間質に入り込みやすくすると同時に、子宮内膜間質が胚とじかに接することによって胚が生存できるよう働きかけていることを明らかにしました。Investigation」(オンライン版)に掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。国立遺伝学研究所の東光一特任研究員および黒川顕教授らのグループは、微生物群集構造の大規模データから様々な環境と微生物とのつながりを明らかにし、その結果を利用して環境と微生物のつながりを可視化するウェブツール「LEA」(http://leamicrobe.jp)を開発しました。中田友明講師らの研究グループ(イモリネットワークNNNプロジェクトグループ)は、アカハライモリの遺伝子(mRNA)情報を網羅する新たなデータベースを独自に開発し、公開しました。Reportsに公開されました。川上浩一教授らの研究グループは、モデル生物のゼブラフィッシュにおいて特定の脳神経細胞を可視化したり、操作したりする技術の開発に成功してきました。今回、これらの技術を駆使して、終脳のDmとよばれる領域の特定の神経細胞が恐怖条件付け学習に重要であることを突き止めました。プレスリリースされました。ナガサキアゲハのベイツ型擬態の原因遺伝子領域を解明するとともに、その構造や進化に関して興味深い事実を明らかにした。Advances」オンラインジャーナルに掲載され、東京大学からプレスリリースされました。センター研究員(研究当時)、二階堂愛ユニットリーダーらの共同研究チーム※は、大量の1細胞由来RNAを網羅的、高精度かつ低コストで計測する高出力型1細胞RNAシーケンス法「Quartz-Seq2(クォーツ・セックツー)」を開発しました。Biology』(2018年3月9日付)に掲載され、理化学研究所からプレスリリースされました。研究グループは、性進化のモデル生物群「緑藻ボルボックス系列」の次世代シーケンスを用いた全ゲノム解読を実施し、オスとメスが誕生した直前と直後に相当する生物の性染色体領域の全貌を明らかにしました。Biology誌に掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。共同で、感染防御やがん免疫に関わる貪食細胞の産生における遺伝子発現制御の分子メカニズムを解明しました。Reportsに掲載され、横浜市立大学よりプレスリリースされました。ユニットリーダーらの研究チームは、これまで検出が難しかった多様なRNAの発現量と完全長を1細胞で計測できる「1細胞完全長トータルRNAシーケンス法『RamDA-seq』」を開発しました。Communications』(2月12日付け)に掲載されました。CCR4-NOT蛋白質複合体がオートファジー分子Atg7を介した細胞死を阻害することにより心機能改善効果をもたらすことを発見しました。Signaling」のオンライン速報版に掲載され、秋田大学よりプレスリリースされました。ハワイ大学との共同研究チームは、大規模なゲノム(注2)データ解析を行い、海洋表層に生息する細菌には光からエネルギーを得る「太陽電池型」と色素で光を遮る「日傘型」の適応戦略があることを発見しました。種類の小分子RNAによって制御されていることを発見し、これら2つの経路による制御が持続感染成立のコアメカニズムの一端を担っていることを明らかにしました。Research」オンライン版に掲載されました。花田耕介准教授らの研究グループ等との共同研究により、転写開始点のコントロールが、転写や翻訳と並んで、真核生物の遺伝子発現制御における新しい普遍的なステップとして、タンパク質の種類の増加に少なからず寄与することを、世界に先駆けて示しました。その研究成果がCell誌2017年11月9日号に掲載され、プレスリリースされました。詳しくは以下の研究紹介記事をご参照ください。学習院大学教授らの研究グループは、霊長類研究所のチンパンジー親子3個体(父:アキラ、母:アイ、息子:アユム)の全ゲノム配列(遺伝情報の配列)を高精度で決定(解明)し、父親・母親それぞれのゲノムが子どもに受け継がれる際に起きるゲノムの変化を明らかにしました。Reports」オンライン版に掲載され、プレスリリースされました。よって、ジェネラリストはスペシャリストに比べて高い種分化率と絶滅への耐性を持ち、子孫を繁栄させる上で有利であることを明らかにしました。Communicationsに掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。(上田貴志教授)、東北大学(経塚淳子教授)をはじめとする国内外39の大学・研究機関と共同で、ゼニゴケの全ゲノム構造を解明し、その研究成果がCell誌2017年10月5日号に掲載され(*)、プレスリリースされました。詳しくは以下の研究紹介記事をご参照ください。らの研究グループは、ヒトiPS細胞から効率よくII型肺胞上皮細胞を作製し、3ヶ月以上にわたって長期培養することに成功しました。国立がん研究センター研究所分野長らと共同で、ヒトiPS細胞からII型肺胞上皮細胞に分化する過程を1細胞ごとの遺伝子レベルで詳細に解析し、マウスの同じ細胞と似たようなパターンを取ることを明らかにしました。Methods」オンライン版に掲載され、東京大学、AMEDからプレスリリースされました。らとの共同研究により、神経幹細胞の性質が変化するメカニズムを明らかにしました。Reports」のオンライン版に掲載され、九州大学からプレスリリースされました。啓介研究員らのグループは、萎凋病感受性のネギと萎凋病抵抗性を有する近縁種シャロットの掛け合わせから得られた添加系統シリーズを用いて抗菌成分として知られるサポニン類の成合成経路中の遺伝子発現を網羅的に比較解析し、萎凋病抵抗性に関与する遺伝子群の特定に成功しました。ONE電子版』に掲載され、プレスリリースされました。深川竜郎教授らの研究グループは、染色体が次世代の細胞へ伝わる際に重要なセントロメアが形成される仕組みを明らかにしました。Cell」(オンライン)に掲載され、大阪大学よりプレスリリースされました。どちらも独立した痛風リスクであることを明らかにしました。Reports(サイエンティフィック・リポーツ)誌に掲載され、防衛医科大学校よりプレスリリースされました。共同で、RNA分解酵素Regnase-1が鉄代謝に関連する遺伝子のmRNA(遺伝情報をタンパク質へ翻訳するために情報を伝達する核酸)を分解することで、貧血時に鉄の吸収を促進することを解明しました。鉄代謝異常による疾患の病態解明や、新たな治療法の開発に繋がることが期待されます。グループディレクターらの国際共同研究グループは、寄生植物が植物ホルモンであるサイトカイニンを使って宿主植物の成長を操作し、効率のよい寄生を実現していることを発見しました。Sciences(PNAS)』への掲載に先立ち、オンライン版に掲載され、理化学研究所からプレスリリースされました。解析により、この鳥を含めたダチョウなどの飛べない鳥のグループである走鳥類全体の進化のあらすじを解明しました。カレントバイオロジー)に掲載され、国立科学博物館よりプレスリリースされました。らの研究グループは、体内時計がADAR2タンパク質をリズミックに作り出すことにより、特定の時刻にRNA上の遺伝情報が書き換えられているという現象を世界で初めて発見しました。Genetics(オンライン版)に掲載され、東京大学よりプレスリリースされました。プレスリリースされました。深川竜郎教授らの研究グループは、遺伝子が子孫に伝わる際に、重要な働きを担う分子装置であるセントロメアの形成メカニズムを明らかにしました。Communications」に、11月4日)に公開され、大阪大学よりプレスリリースされました。doi:10.1038/ncomms13465[ゲノム支援成果公開]アフリカツメガエルの複雑なゲノムを解読:脊椎動物への進化の原動力「全ゲノム重複」の謎に迫る新学術領域研究「ゲノム支援」では、国際プロジェクトとして進められていたアフリカツメガエルの全ゲノム配列決定を2011年に企画課題として採択し、2015年までの間、大規模な配列解析支援を行いました。この研究成果がNature誌、2016年10月20日号、第538巻に掲載され(*)、東京大学からプレスリリースが行われました。東京大学:(https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2016/5056/)国立遺伝学研究所:(https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2016/10/research-highlights_ja/20161020.html)なお、アフリカツメガエルのゲノムブラウザは次のURLから公開されています。)らとの共同研究において、社会性(対他行動)に特徴があった1頭のニホンザルの行動を詳細に調べることで、このサルが自閉スペクトラム症の特性と類似した行動特徴をもつことを発見しました。Advances』(9月21日付け)に掲載されました。共同で、クマムシの中でも高い耐性を持つヨコヅナクマムシの高精度なゲノム配列を決定し、クマムシに固有な多数の遺伝子を発見しました。名付けた遺伝子をヒト培養細胞に導入すると、放射線などによるDNA傷害が抑制され、放射線耐性が向上することが明らかになりました。Communicationsに掲載され、プレスリリースされました。外山史准教授らと共同で、アカハライモリの遺伝子改変技術を駆使して、転写因子Pax61)が成体イモリの網膜再生に必須であることを明らかにしました。Reports」に公開され、筑波大学よりプレスリリースされました。阿形清和教授との共同研究により、ほ乳類神経モデル細胞を用いて、1,000を超える遺伝子にプロモーターノンコーディングRNA(pancRNA)がペアとなって存在することを発見していましたが(2015年2月15日付けプレスリリース)、これらは、エネルギーを供給されても細胞が増殖せずに安定的に維持されるメカニズムに必須であることを今回新たに発見しました。Research』のオンライン版で掲載され、九州大学よりプレスリリースされました。型アルデヒド脱水素酵素(ALDH2)遺伝子が痛風の発症に関わっていることを発見しました。Reports誌」に掲載され、防衛医科大学校よりプレスリリースされました。pectorale)の全ゲノム解読を実施しました。その結果、多細胞化の初期段階の鍵となる遺伝子群を発見しました。河野重行教授らの共同研究グループは、重イオンビームで作り出した変異体と独自に開発したプログラムを用いて、ゲノム配列決定[2]が難しい植物Y染色体の遺伝子地図の作成に成功しました。Reports』(1月8日付け)に掲載され、理化学研究所よりプレスリリースされました。支援による成果を含む論文として支援依頼者から報告があった論文を発表の新しい順に並べました。成果論文には「先進ゲノム支援」の課題番号を謝辞に入れることをお願いしていますが、現状は以下も含めています。先進ゲノム支援(先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム).。