いうソフトウェアがあります。座標求めることができます。リファレンスゲノム(FASTAファイル)から、求めた座標に該当する領域の配列を抽出することも可能です。具体的な配列操作のイメージは、下記の解説が分かりやすいです。getfastaその他の操作もイメージつきで解説されています。(このようなソフトウェアの解説は、まず、作成者の準備したドキュメントに目を通すことをお勧めします。有用なことが多く書かれています。使ってインストールできます。タップを追加する必要があります。ない場合は上記のコマンドのログにその旨が表示されますので、それに従います。(1)NGSのデータ解析時に用いられるファイルの形式は様々なフォーマットがあります。名前もよく似ているものが多く、初めは混乱するかもしれません。各種フォーマットの解説があります。(ふぁすときゅー)とBAM(ばむ)です。シーケンサーで検出されたリードの配列を保存したものです。FASTA(ふぁすた)というフォーマットがあり、それに加え、シーケンサーで読み取った各塩基のクオリティーのスコアを格納したものです。リードを1本1本、記録しているため、数千万行から数億行の大きなサイズのファイルです。テキストファイルですので、テキストエディタで開くと、文字が読めます。(圧縮されている場合は、一度展開する必要があります。エディタによってはそのまま読めるものもあります。