ArmorTV『少年エース』にて連載された同名人気コミックを原作に、最強の生体兵器"ガイバー"の活躍を描くSFバトルアクション・アニメ。ある日、平凡な高校生・深町晶は、学校からの帰りに謎の物体"ユニットG"に接触してしまう。そのため、生体兵器"ガイバー"に殖装してしまった晶は、世界征服を狙う謎の秘密結社"クロノス"と闘う宿命を背負うことになった。晶は手にした力の巨大さに戸惑いながらも、クロノスが操る恐ろしい獣化兵"ゾアノイド"と戦っていくのだが...。