]追加された行はこの色です。削除された行はこの色です。したリファレンスを作ってみようと思います。PyMOLリファレンスを参考にしています。日本語に訳してあるのでオリジナルドキュメントとはニュアンスが微妙に異なるかもしれませんが、本ドキュメント内で使用する用語をまとめておきます。様々な操作の基本となるオブジェクト。panel)内にはカッコなしで表示されます。分子オブジェクト、距離オブジェクトなどがあります。オブジェクト内で選択された残基や原子。色を変更したり、隠したりすることができますが、一部の操作(セレクションだけスティックの太さを変えるなど)はできません。その場合は''create''を使ってオブジェクト化することで操作可能になります。stateをそのまま訳すと「状態」になると思いますがなんとなくしっくりこないので、属性とします。線の太さや色などを表します。Ctrl+右クリック(1原子を選択)、Ctrl+真ん中クリック(4原子までを選択)で選択すること。ピックされた原子は名前パネル中にセレクションとして(pk*)で表されます。2原子をピックした状態で''distance''などを実行するとそれらの原子間に対して操作を行うことができます。(pk*)に対して操作を行うこともできるようです。対象となる原子同士の結合を作成します。対象を指定しない場合は、ピックされた2つの原子間を結合します。結合する原子は同一オブジェクト内に限ります。セレクションから分子オブジェクトを作成します。分子オブジェクトを作成することで、セレクションには設定できない属性などを操作することができます。source_stateおよびtarget_stateが共に0の時(ディフォルト)は、全ての属性が引き継がれます。それ以外の時は指定された属性のみがコピーされます(よくわからない・・・)。対象となる原子同士の距離オブジェクトを作成します。対象を指定しない場合は、ピックされた2つの原子間を結合します。[Wizard]->[Measurement]を使うと距離オブジェクトを簡単に作成することができます。属性値をセットします。主な属性名を以下にまとめておきます。詳細は[[クックブック>../クックブック]]を参照して下さい。