壽福寺を建て、建仁二年・京都に建仁寺(開基・源頼家)を建てた。栄西の弟子明全(みょうぜん)に師事した道元は曹洞宗を日本に伝え、日本の開祖となり、越前に永平寺を建て修業に専念。臨済宗が貴族や武士階級に広まったのに対し曹洞宗は庶民の間に浸透した。鎌倉に建立されたことによって、日本全国に禅宗が流布する源が出来た。その後北条時宗により、南宋の臨済僧・無学祖元を開山に招き(弘安五年)円覚寺を建てた。禅宗は自力本願であり、坐禅により自ら悟りを開くことを重んじる。常に戦場にあった武士は、人生の無常観と罪の意識に目覚めるにつれ、自らの生き方を問うため禅の教えを学び、実践した。建長寺や円覚寺では、現在も雲水が托鉢を行い、一般家庭を訪ねている。不殺生戒の教えから魚や肉を使わず、旬の素材を無駄なく使う精進料理(けんちん汁)は建長汁がなまって呼ばれるようになったと言われている。