Note夜神月は、警視庁捜査一課に勤務する父・総一郎と妹・粧裕と暮らすどこにでもいるような大学生。弥海砂の所属する「イチゴBERRY」のライブに行き、感想をはてなブログで書く以外は、学業とアルバイトに精を出す日々だ。親友の鴨田のつけたはてなブックマークコメントを嘲笑。逆にスクショを取られて拡散され、炎上してしまう。その帰り道、空からノートパソコンが舞い落ちてきた。Note」という謎のサイトしか開けない。不思議なことに、インターネットに接続していなくても、そのサイトにはアクセスできるのだった。