センターでは,高山試験地のある冷温帯地域の森林および農耕地の炭素循環研究を推進しています。TKY)はおよそ50年生の落葉広葉樹林内に設定されており,ダケカンバ,シラカンバ,ミズナラなどが林冠層を形成し,林床はクマイザサに覆われています。当地では1993年の冬から微気象学的な手法による二酸化炭素フラックスの観測が継続されており,アジア地域では最も長期間のデータを蓄積しています。フラックス観測と並行して,バイオマス計測や土壌呼吸測定,植物の光合成・呼吸特性などの生態学的な手法により炭素循環と収支のメカニズムの解明を目指しています。よって、地上観測−生態系モデリング−衛星リモートセンシングの融合による陸域炭素収支評価の統合研究拠点に発展しました。本COEの研究の一環として,2004年冬には常緑針葉樹林(およそ50年生のスギ人工林)にもタワーを建設し,フラックス観測を開始ています。2012年には落葉広葉樹林サイトにおいて,樹木および土壌の温暖化実験も開始しました。地球環境フロンティア研究センターなどの研究者や学生も推進しており,共同作業や共同研究を通じた研究交流が盛んに行われています。network)にも登録され,日本中の生態系研究サイトとの連携を目指しています。