全症例で最低1つの疾患原因遺伝子があることもわかった。遺伝子異常のカテゴリー(1)ミエロイド分化に関係する転写因子:RUNX1,CEBPAこれらが異常になると正常な白血球分化を阻害してそれがAML発症の引きがねとなる。ほかの固形がんに比べると少ないが予後不良因子となっている。いずれも単独でAMLをおこすことはないと考えられている。細胞増殖を促進するヒトはマウスよりも腫瘍化しにくい生物である。3.AMLの複数クローンAMLは診断時からすでに複数のサブクローンがいることがわかってきた。AMLは単一クローンからだけなっているのではなく、異なる遺伝子変異のある細胞の集団なのである。これが抗がん剤が途中で耐性となったり再発することと関係があると考えられていて、実は再発時のクローンは初発時から存在することもわかってきた。クローン性造血がみられることがあり、65歳以上では約10%で認められる。これがあるヒトはその後造血器腫瘍を発生する確率が有意に高い。おもしろいことにそれらのクローン造血を認める人には冠動脈疾患や脳卒中が発生する頻度も高い。クローン性造血に関係する遺伝子変異は3つ。いずれもamlのエピゲノム遺伝子である。最近ではAMLの中に前白血病幹細胞をいうべき細胞が存在すると言われ始めていて、それは造血幹細胞と同様に多系統に分化する能力と比較的強い幹細胞活性をもち、DNMT3Aなどの造血器関連の遺伝子変異がある。これらが体内で増殖して、さらにそこに遺伝子変異が加わることでAMLが発症すると考えられている。クローン性造血があってもすべての高齢者がAMLとなるわけではなく、予防投与すべきかどうかは不明である。