卓越大学院プログラムは、農学と工学の協創によって新たな産業創出に貢献する博士人材の養成を目的としています。成長産業としての農業には、育種や生産から、加工・流通、さらには各家庭の消費や外食産業など農産物流通のシステム全体を対象にしたシステムイノベーションの基盤強化が必須です。エネルギー制御、バイオ、環境など含め、東京農工大学の農学と工学のすべての研究分野を対象とします。この大学院教育の実現には、産業界がコミットする教育体制が不可欠です。連携機関として企業等が参画することにより新産業創出コンソーシアムを組織し、産官学一体となって人材の育成にあたります。