Hardy-Weinberg平衡HWEの正確検定についてこんな記事(こちら)を書いた。そこでは、N人についての観測を、Nx2分割表として正確確率を計算することを述べた。このNx2分割表についてのカイ自乗統計量がどのようにHWE検定のカイ自乗統計量と関係しているかを考える。2N今、ホモがa人、ヘテロがb人、逆ホモがc人だとする。このNx2分割表のカイ自乗値はこれを整理するとである。この統計量は、Nx2個のセルがすべて均一だったときに0となるような統計量である。この統計量はヘテロ人数について算出すると、もっともヘテロ人数を多くした場合に、もっとも小さい値をとる。あるから、この統計量がそのままHWEからの逸脱の程度を表すものとしては使えない。実際にHWEについて検討するにあたっては、HWE状態にあるようなa',b',c'からの逸脱の程度を計量することになる。HWEからの逸脱の程度を表している。してやると、これが、実は、a,b,cとに対して、期待値をa',b',c'としたときのカイ自乗統計量に一致する。当然のような、不思議なような感じである。Nx2表において、自由度はN-1であったが、比較した相手とは変数が1個分しか違わないので、この統計量は自由度1で検定する。GWAS/GWASメタアナリシスとその周辺解析用のアプリケーションへのリンク複合遺伝性疾患とは----------News----------20万アクセス2008/07/2040万アクセス2010/09/12-------------------------はてなブログをはじめよう!ryamada22さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。