RNA試料を用いて独立に4ロットを調製し遺伝子発現解析(MS-Profiling)を行った。高い再現性を有していることが示された(図1)。従来のハイブリダイズ法では検出不可能な1.2倍の発現差を検出可能であることがわかった。戻る実施例:ノックアウトマウスにおける転写産物プロファイリングノックアウトマウス由来の細胞を用いて遺伝子発現解析を行なった。その結果、ノックアウトした遺伝子の発現消失以外にも、ノックアウトした遺伝子の下流因子と考えられる既知または未知遺伝子の発現量変化が観察された(図2、表1)。この結果は、これら約500遺伝子がノックアウトした遺伝子により、直接または間接的に発現制御されていることを示している。RNAを抽出し、得られたRNA試料を用いて遺伝子発現解析を行った。その結果、X線照射によりp21遺伝子の発現レベルの増加が検出された。p21遺伝子の発現レベルの変化を確認するためにRT-PCRを実施した結果、p21遺伝子の発現レベルの増加を確認することができた(図3)。上に戻る実施例:薬剤刺激を加えた培養細胞における転写産物プロファイリングマウス由来培養細胞に対して培養12時間目に薬剤刺激を加えた。RNAを抽出し、得られたRNA試料を用いて遺伝子発現解析を行った。その結果、約15000種の転写産物を検出し、2倍以上発現レベルの上昇または減少した遺伝子がそれぞれ約50遺伝子ずつ検出された(表2)。薬剤刺激によるマーカー遺伝子の検索に使用できることが明らかとなった。