Dimension小さく、かつ美しい星、リトルプラネット。この星は、一年の内の1ヶ月の間、巨大な湖ネバーレイクの上空にやってきます。眠る星でもありました。タイムストーンが起こす出来事は、砂漠がジャングルに、汚染された湖が美しい湖に・・・、と時間を超えた不思議なものばかりでした。それに目をつけたのは、あの悪の天才科学者ドクター・エッグマンでした。「タイムストーンが眠る星、リトルプラネットこそ我が要塞にふさわしい!」と、リトルプラネットをネバーレイク上空に固定し、巨大な要塞を造りはじめました。全てのタイムストーンを手に入れ、時間を自由自在に支配し、世界征服の野望を達成させるべく、行動をはじめたのです。何も知らないソニックは、リトルプラネットに会いに行くため、ネバーレイクへ・・・。「何?ソニックがやってきただと?・・・それは好都合だ。報告を聞いたドクター・エッグマンは、不敵な笑みを浮かべながら目を輝かせました。駆けつけたソニックが見たものは、岩からのびるクサリで固定され、無残な姿となったリトルプラネットでした。見ると、岩の斜面にはドクター・エッグマンの顔が・・・。「今度こそ、ワシのか学力でひねりつぶしてくれる・・・!そして、タイムストーンをそろえ、世界を征服するのじゃ!フォ、フォ、フォ・・・。無気味な笑いで待ち伏せる、ドクター・エッグマンとその陰にひそむ蒼い閃光・・・。