空戦魔導士の育成機関である学園浮遊都市«ミストガン»の生徒、カナタ・エイジは<<黒の聖剣(クロノス)>>の称号を持つエリートエース。今では“とある事件”から「裏切り者」の烙印を押され、前線を退いていた。そんなカナタが、“落ちこぼれ”と揶揄されるE601小隊の教官に任命される。この小隊に所属するのは、一癖も二癖もある3人の少女。“裏切り者”教官の型破りな指導で「最強の空戦魔導士」を目指す!“落ちこぼれ”少女たちの成長の物語が今、始まる。