R言語・グラフバイオインフォ道場、くまぞうです。Rでグラフを描画する場合、位置やサイズを自動で調整してくれるので大変便利です。カスタマイズしようと思えば、色々なパラメータを調整する必要があります。綺麗なグラフに仕上げるために、軸の目盛りの調整についてまとめます。散布図ヒートマップボックスプロットよく使うオプションこんなときはどうする?目盛りの文字の大きさを調整したい場合は?余白を調整したい場合は?ラベルの向きを調整したい?任意の間隔・内容で軸ラベルを表示したい?データの近くにテキストを表示したい?目盛りのベキ乗表記を出来るだけ避けたい?軸のラベルについてスポンサーリンク基本的な使い方グラフの描画の際、x軸・y軸のラベルや目盛りを意識することは少ないように思います。間隔や表示すべきデータをRが調整して、美しいグラフを仕上げることが出来ます。バイオインフォマティクスでも、散布図やヒートマップ・ボックスプロットなど色々なグラフを使いますが、細かい表現を気にしなければ簡単に描画することが出来ます。(n乗)などを調整することが多いようです。表示するデータのレンジが広い場合は、一部が10のn乗の表記になることがあります。plot(data)ヒートマップ各軸に表示する文字が長い場合は、文字の大きさや向き調整したり・余白を広めにとるなどの調整が必要になります。1ボックスプロット並べる項目数が多くなる・表示する文字が長くなると、文字のサイズや向きの調整が必要になります。F※sprayの項目名を「spray_data_」で修飾よく使うオプション軸の目盛りやラベル表示に関連して、表現を少し工夫する場合はオプションを設定します。ylab軸のラベルを指定します。ylim軸に対する表示範囲を指定します。ylogそれぞれの軸を対数スケールで指定します。cex.lab軸のラベルの大きさを調整します。(デフォルトサイズに対する倍数指定)cex.axis軸の目盛りの大きさを調整します。(デフォルトサイズに対する倍数指定)las軸の目盛りの向きを調整します。marプロット領域のマージンを調整します。parグラフィカルパラメータの確認や設定を行うときに使います。グラフの描き方こんなときはどうする?目盛りの文字の大きさを調整したい場合は?目盛りの文字の大きさを調整するには、cex.axisオプションを指定します。デフォルトサイズに対する倍率で指定するので、0.2...0.5くらいの数値を設定して微調整すると設定しやすいと思います。par()関数で設定して描画します。col="lightgray")heatmap関数の場合は、ラベルの大きさを制御するオプションとしてcexRow・cexColが準備されています。デフォルトサイズに対する倍率で指定するので、0.2...0.5くらいの数値を設定して微調整すると設定しやすいと思います。デフォルトは、0.2をベースにして、列数や行数で自動で微調整されます。実際は、グラフの外側領域のサイズを調整しつつ、文字の大きさを調整すると良いと思います。cexRow=0.5)余白を調整したい場合は?余白のサイズを調整するには、グラフィカルパラメータを調整します。グラフ描画に関しては、プロット領域のマージンを調整することが多いのですが、その場合はレイアウトパラメータmarを調整します。具体的には、par()関数を使って設定を行います。par()関数でマージンを設定後に描画すると、マージン設定を反映したプロットが描画されます。col="lightgray")heatmap関数の場合は、マージンを調整するオプションとして、marginsオプションが準備されています。par$marと異なり2つのパラメータを指定しますが、下マージンと右マージンに対応しています。列名が長い場合や、行名が長い場合は、文字サイズとマージンを調整すると綺麗なヒートマップを描画できます。margins=c(5,10))ラベルの向きを調整したい?boxplotのように項目名を1つ1つ全てに表示したい場合、文字が長くて表示が間引かれたり、描画枠からはみ出てしまうと困ります。そのようなときは、lasオプションを指定します。lasには0〜3までの4つの設定があります。横・縦)で設定できます。par()関数で設定して描画します。label")任意の間隔・内容で軸ラベルを表示したい?軸の目盛りを任意の場所・任意の内容で表示する場合、グラフの表示と軸の表示を分けます。グラフの軸に関する表示を「非表示」に設定し、軸は別で描画します。軸の表示は、axis関数を使います。引数のatで任意の位置を指定し、labelsで表示するテキストを指定します。Female"))データの近くにテキストを表示したい?グラフ描画の際、図だけではわかりにくいので、値をテキストで表示したいときがあります。そのようなときは、text関数を使います。表示位置x・y、データを指定することで、任意の位置に値を表示することができます。col="red")目盛りのベキ乗表記を出来るだけ避けたい?レンジが広いデータを扱う場合、目盛りの一部や片方の軸だけベキ乗表示になる場合があります。そのようなときは、プロット情報をもとに目盛りを作りなおして、axis関数で別途表示を検討します。私が転職を簡単に、且つ、有利に進めれた理由あなたの英会話レッスンを応援します。当ブログで掲載している画像の著作権・肖像権等は各権利所有者に帰属致します。権利を侵害する目的ではございません。直接メールでご連絡下さい。確認後、対応させて頂きます。当ブログのコンテンツ・情報につきまして、可能な限り正確な情報を掲載するよう努めておりますが、誤情報が入り込んだり、情報が古くなっていることもございます。当ブログからリンクやバナーなどによって他のサイトに移動された場合、移動先サイトで提供される情報、サービス等について一切の責任を負いません。閲覧者が当ブログの情報を直接または間接に利用したことで被ったいかなる損害についても当サイト運営者は一切の責任を負いません。当ブログは投資の助言あるいは投資の勧誘等を行うものではありません。ついて保証するものではありません。FXや投資信託はリスクや損失が存在する金融商品です。十分に理解したうえで自己責任で行ってください。