ISSN:0917009X概要:あの時こうしていれば──。自分の人生を振り返って「if」を考えるのは,ほとんどの場合あまり建設的ではない。ISSN:09196072概要:近年、細胞内に人工的な遺伝子回路を構築することを手段とするsyntheticbiologyが興隆している。その成果として、細胞内の遺伝子回路の振る舞いについて興味深い知見も得られつつあるが、細胞というブラックボックスに対して解析を行うことの問題点は避けることができなかった。これに対し本発表では、各種生体分子を調製して混合することで人工的な遺伝子回路を試験管内に構築する我々の戦略について報告する。本研究が、情報科学と生命科壜学の共同研究として始まったDNAコンピュータ開発の流れを受け、どのように進展してきたかついて紹介する。研究成果概要:本研究は、初期生命が用いるアミノ酸の種類を追及する申請者の一連の研究を拡張するための、基礎となるものである。全生物の共通祖先も、ある段階では現在の生命と同じように、20種類のアミノ酸をタンパク質合成に用いていたことは間違いない。...本研究は、初期生命が用いるアミノ酸の種類を追及する申請者の一連の研究を拡張するための、基礎となるものである。全生物の共通祖先も、ある段階では現在の生命と同じように、20種類のアミノ酸をタンパク質合成に用いていたことは間違いない。生命の初期進化を考察するために、それ以前、20種類のアミノ酸を用いる以前の遺伝暗号について追及する必要がある。そこで、本研究では、遺伝暗号に最後に加わった可能性が高いトリプトファン(Trp)が存在せずとも動作する解糖系を再現する。研究成果概要:合成生物学に対する過度の期待は、普遍的な理解の達成よりも、従来の生物工学を延長したにとどまる個々の生産系の構築を優先させる動機づけとなってしまった。本研究では、理工学一般にみられる多階層モデルを活用して部分システムの組み合わせを設...合成生物学に対する過度の期待は、普遍的な理解の達成よりも、従来の生物工学を延長したにとどまる個々の生産系の構築を優先させる動機づけとなってしまった。本研究では、理工学一般にみられる多階層モデルを活用して部分システムの組み合わせを設計・評価する、という研究サイクルの適用先として、生物学としても重要な、細胞間の通信に基づく多階層系を選択した。研究代表の木賀は、合成生物学アプローチで部分システムの組み合わせを構築し、実験と数理モデルとの整合性のある理解を達成している。本研究は、これを、合成生物学で重要な社会との関わりの調査を含めた、より広い分野に拡大するものである。研究成果概要:本研究の目的は、各種反応条件による反応の進行を解析することで、低分子触媒による反応が、高分子酵素による触媒に遷移する過程を考察することにある。その過程において、(1)反応条件のバラエティ、(2)触媒となるタンパク質酵素のアミノ酸配...本研究の目的は、各種反応条件による反応の進行を解析することで、低分子触媒による反応が、高分子酵素による触媒に遷移する過程を考察することにある。その過程において、(1)反応条件のバラエティ、(2)触媒となるタンパク質酵素のアミノ酸配列における少数の置換に起因するバラエティ、2つのバラエティの組み合わせについて、反応を測定する必要がある。本学における研究室立ち上げの年度となる本年度については、特に、タンパク質酵素の種々の変異体を作成しその活性を評価した。研究成果概要:本研究の目的は、各種反応条件による反応の進行を解析することで、低分子触媒による反応が、高分子酵素による触媒に遷移する過程を考察することにある。その過程において、(1)反応条件のバラエティ、(2)触媒となるタンパク質酵素のアミノ酸配...本研究の目的は、各種反応条件による反応の進行を解析することで、低分子触媒による反応が、高分子酵素による触媒に遷移する過程を考察することにある。その過程において、(1)反応条件のバラエティ、(2)触媒となるタンパク質酵素のアミノ酸配列における少数の置換に起因するバラエティ、2つのバラエティの組み合わせについて、反応を測定する必要がある。本学における研究室立ち上げの年度となる本年度については、特に、タンパク質酵素の種々の変異体を作成しその活性を評価した。