Runtimeに対応していない状態だったためNotarizationに失敗していました。Runtimeへの対応はアプリのビルド時ではなく、コードサインでフラグを立てることでなされます。Runtime対応となります。Phaseでバイナリをコピーするようにしていたので、これらコピーで追加した実行ファイルは独自に署名してやる必要があります。Phaseにcodesignコマンドの呼び出しを追加しました。引数は$CODE_SIGN_IDENTITYに置き換えて、このような形にしています。ビルドするための環境を整えないといけないと思っていたのでだいぶ道のりは長いかと思ったのですが、意外とすんなり行ってよかったです。コマンドでアップロード後、非同期で処理に数分かかります。Centerでやるのはあまり得策ではない気がしてきました...WebHookで他のCIやLambdaなどで監視したほうが良い気がしています。