その後は数カ月間に渡って、他の特異な能力を持つ実験体を調べ上げて自身の人体改造の材料としたり、仙術を身につけるため龍地洞を探し出し白蛇仙人の元で修行を積んで完全な仙人モードを体得したり、穢土転生の転生対象を探すために様々な場所を巡って強者のDNAを集めたりして力を蓄えていった。この時、木ノ葉と暁の共倒れを狙っていたカブトは木ノ葉の追っ手をアジトに導くためわざと痕跡を残しつつ殺しながら進んだ。アジトに到着し、対面して早々トビはカブトを元々サソリのスパイだった暁の裏切り者として攻撃をしかけてきた。一度は断ろうとしたトビだが、更に本物のうちはマダラを穢土転生したことで交渉成立となった。ヤマト捕獲ヤマトを捕獲しばらく後、鬼鮫からキラービーとナルトの潜伏場所を記した巻物が届いた。トビに信頼してもらうチャンスとして、自ら八尾と九尾を取りに行くと言った。自分の集めた研究材料と知識があれば白ゼツを強化できると説明し、柱間の人造体と外道魔像がある場所へと案内してもらった。そこでトビが尾獣達のチャクラを使って作った10万体の白ゼツを見た。進んだところ島亀の周辺を見回りにきていた三代目土影・オオノキから攻撃を食らうが、待ち伏せされていることをわかっていたカブトもデイダラも粘土分身であり、至近距離で起爆させた。相手も考えることは同じで、岩分身であった。オオノキらとの上空戦を繰り広げる一方で、二代目マンダには海の中を泳がせており、広範囲を感知できる二代目マンダは島亀を見つけ出して尻尾に噛みつき、島亀は喚声をあげた。その声で島亀の場所がわかったカブトは早速その場へ向かい、二代目マンダとデイダラの起爆粘土の爆発で島亀を身動きが取れないようにひっくり返した。蛇にナルトの場所を感知させ、その場に向かおうとするが、黒ツチによって足止めを食らう。これを利用してわざと術にかかって捕まるふりをし、山城アオバが情報を抜き取ろうとした瞬間に脱皮をして逃れて近くにいたヤマトを丸呑みにして捕獲した。その後はビーとナルトまで深追いはせず、デイダラを棺に戻して自分は二代目マンダの鼻の穴に隠れて口寄せを解いて撤退した。アジトに戻ると、トビから手土産が違うとして問い詰められた。「こいつでゼツ達をかなり強化できる。戦争の準備が整い、穢土転生した多くの手練たちを各地に散らし、第四次忍界大戦は開幕した。その頃、忍連合の奇襲部隊と交戦していたデイダラ・サソリら穢土転生体が封印され、サソリとシンの魂が昇天したのを感じ取った。アジトの性格な場所を知っているアンコを殺せとトビから命じられるが、穢土転生の縛りを強くするのに必要だと説明した。カブトの利で自分が不利になるかもしれないと危惧したトビから解き方も含めて穢土転生という術の全てを教えろと命じられる。