緑の深層の中に、ひっそりと佇む学園とその寄宿舎。西洋風の古い趣を感じさせる建造物と近未来のハイテクノロジー設備が混在融合するその学園で、生徒たちは、同じ年頃の少年たちと変わらず、思春期の多感な時期を謳歌していた。彼らには、同じ年頃の少年たちとは決定的に異なる秘密があった。特殊な潜在能力PSYを持ったCLOUD-BLUE(クラウド・ブルー)と呼ばれる少年たち、それが彼らの正体であった。彼らが集められた目的とは何なのか。学園に現れたひとりの転校生。彼の存在が、少年たちを逃れられない運命へと飲み込んでゆく。