2000年に東証マザーズに上場し、2002年に東証二部に、2006年に東証一部に市場変更。2007年に国内グループウェア市場でシェア1位を獲得した。「サイボウズ」の由来は、「電脳」を意味する「cyber」と、親しみを込めた「子供」の呼び方「坊主(bozu)」を組み合わせた造語で、「電脳社会の未来を担う者達」という意味も込められている。「サイボウズ」ロゴマークの由来・意味2015年に制定された2代目ロゴで、創業18年目に東京オフィスを移転するタイミングに合わせて導入された。サークル(輪)をモチーフとしており、カラーバリエーション、配置のバリエーションが多数あるのが特徴で、それぞれが同社の重視している文化を表現している。サークルがどの角度から見ても変わらない事から「公明正大」である事を、変化するモチーフの色や配置で、1つの価値観に縛られない「多様性」を表現している。二項対立と、それを解決する第3のイノベーション等、同社が目指すビジョンを表現しており、同社の創業者が3人だったことにも由来している。