1990年(平成2年)3月10日:於札内駅に営業キロを設定。11月21日:釜谷臼駅に交換設備を設置。12月25日:新川駅を業務委託駅に変更し、有人化。1993年(平成5年)月日不詳:浦臼駅の簡易委託を廃止し、無人駅に変更。線を札沼線列車専用の「北線[7]」として札沼線列車と函館本線列車を分離[6]。函館本線は、上下線の間に2本あった既存の札幌駅引き上げ線のうち1本を桑園駅まで延長し、新下り線とした。桑園駅2番線(函館本線下り)から北線への片渡り線が設置されているため[7]、設備上は引き続き「北線」を函館本線下り列車が走行することも可能である(逆は不可)。新十津川駅間でワンマン運転開始[37]。(新川駅)間を高架化[3][37]。八軒駅を業務委託駅に変更し、有人化。4月1日:新十津川駅の読み方を「しんとつがわ」から「しんとつかわ」に変更[3]。1999年(平成11年)月日不詳:石狩太美駅の簡易委託を廃止し、無人駅に変更。-(太平駅)間を高架化[37]。