甲府駅にてクハE353-1~20基本編成4号車として連結される東京方の制御車(Tc)で、床下にCPを搭載する。3位側に洗面所と男子用小便所、4位側に洋式便所が設置されている。台車は前位がTR265、後位がTR265A。甲府駅にてクハE352-1~20基本編成12号車として連結される松本方の制御車(Tc')で、床下にCPを搭載する。客室2位側に荷物置場を設置。台車は前位がTR265、後位がTR265A。定員は量産先行車では当初60名であったが、量産車と量産先行車の量産化改造後は荷物置場設置により58名である。甲府駅にてサロE353-1~20基本編成9号車として連結されるグリーン付随車(Ts)。前位側から車体中央部にかけて客室(定員30名)を設けでいる。車体中央寄りには車椅子対応の1人掛け座席2席が設けられている。荷物置場は通路に設置されたため、普通車と異なり、量産化改造後の量産先行車においても定員と外観には変化はない。甲府駅にてサハE353-1~20基本編成8号車として連結される付随車(T)。床下にSIV(SC110)およびCPを搭載。3位側に洗面所と男子用小便所、4位側に洋式便所が設置されている。