1987~1994年の間に臨床検査でBウイルス感染が確認された5名は、中枢神経系症状が出現する前またはその初期段階に、高用量のアシクロビルまたはガンシクロビルの静脈内投与を受け、治療開始後2~3週間で症状が消失した。静脈内投与は腎毒性や神経毒性を示すことがあるため、経口投与も行われる。中には4~7年間の経口投与を受けた例もあるが、とくに副作用は報告されていない。Bウイルスに暴露された可能性のある場合の予防法と治療法に関するガイドラインがCDCを中心とした専門家グループにより作成されており、日本語訳も作られている(オベリスク、増刊号1997年10月)。サルを取り扱う作業者用としてBウイルス糖蛋白gD遺伝子をワクチニアウイルスに組み込んだ組換えワクチンを開発し、ウサギでBウイルスの致死的攻撃接種に対して防御が成立したと報告している。Bウイルス感染が非常に限られていることから、このワクチンの単独実用化は考えにくい。