2013年07月たのしいPython今夜コードを書いているすべてのヒトへプロフィールAuthor:辻真吾(つじしんご)www.tsjshg.infoいまは、大学の研究室を主な拠点に、色々やってます。このブログはPythonの話題が中心ですが、どちらかというと日々の仕事で使う知識を、自分のためにメモしたものです。万が一どなたかの役に立てば光栄です。--pylabが便利です。Webブラウザから利用出来るので、サーバで実行して別のマシンから接続したくなりますが、そのままでは、127.0.0.1からの接続しか許してくれないので設定が必要です。まとめてくれている人を見つけましたので、メモっておきます。ひとつだけ、anaconda1.6で入れた場合、設定ファイルのパスが、~/.config/ipython/profile_myserver/です。notebookは、予想以上に使い心地がよいので、普及に貢献していきたいです。top↑rpy2でJonckheere-Terpstra(ヨンクヒール・タプストラ)検定たとえば、「無治療、ちょっと治療、ちゃんと治療」のように、3個以上のカテゴリに順序があるとき、これらの群間で数値にトレンドがあるかどうかを検定する方法に、Jonckheere-Terpstra(ヨンクヒール・タプストラ)検定という方法があります。詳しくは、Rを使った実例や、Wikipedia(英語)などを参考にしてください。Rにあるのに、scipy.statsに無く、大学の図書館に、この本があったので、Pythonで実装しようかと思ったのですが、面倒になってrpy2を使ってしまいました。数値データは、本の中から引用しています。3事前にRのパッケージのインストールが必要です。biocLite("SAGx")とすれば行けると思いますが、手元の環境ではちょっとエラーが・・・。ま、動いているからいいか。top↑rpy2のインストールに失敗しgccを刷新anacondaで、なんでもいっぺんにインストールされると大喜びしていたのですが、時々こんな感じで使っている、PythonからRを呼ぶことができる、rpy2が含まれていないことに気がつき、早速pipするも、gccがエラー。gccとかやると、出るわ出るわ。何度もOSアップグレードしたりしてるから仕方ないのかなとか思いつつ(ちなみに最近買ったMacBookAirではXcodeのgccで素直に入りました)、探していたら良いのがありました。Installer、Xcodeの重厚長大さにちょっと嫌気が指しているひとが、作ってくれたようです(ここ)。StoreがXcodeのアンインストールに気がつきます。Installerを実行。/usr/bin/gccから小綺麗になったgccを実行できます。めでたく、rpy2のpipにも成功。今回はあんまり関係ないけど、やっぱりpython最高です。