FAQをチェックしましょう。ユーザーリシークエンスの配列作成について1はじめまして。novoアセンブルを行うことなく、マッピングしたのちに何らかの方法で目的のゲノム配列を得られるのではないかと考えています。cns.fqのようにすると新しいゲノム配列が得られるのですが、vcfutils.plではIN/DELが全く考慮されていないようです。何か他にツールをご存知の方がいらっしゃいましたら、教えて頂けませんでしょうか。Answers:回答順最新支持されている順1なるほど、そちらの用途は良いツールがなさそうですね。BioStarでも自前で書く必要がありそうな回答がありました。♦♦515●4●9●220たしかsamtoolsに同梱されているsamtools.plのpileup2fqだとin/delのマスクをしてくれたと思います。♦♦221●2●5gaouさま、お返事ありがとうございます。(pileup用)だとIN/DELのフィルタリングが目的のようでして、出力されるFASTQファイルはリファレンス配列と比べて、IN/DELが全く存在しません。他に何かツールがありそうだと思うのですが。回答とコメントただいまベータテスト運用中です。そのために通知無くコンテンツの変更やサービスの停止変更されることがあります。質問するならライフサイエンスQA。