FAQをチェックしましょう。ユーザーmiRNAのターゲット遺伝子の検索0最近さみしい状態になっておりますが、お聞きしたいことがあり投稿させていただきます。当方、NGSでsmallRNAを解析しております。報告されているmiRNAにつきましてはmiRBaseなどで検索できますが、新しく発見できたmiRNAに関しましてそのターゲットとなる可能性のある遺伝子を予測する方法を探しております。アドバイスをよろしくお願いいたします。そのようなものがないようでしたら、プログラムする際に参考になるアルゴリズムでも非常に助かります。幾つかpublishされています。positiveがひじょうに多いのが現状です。複数のプログラムで予測した結果どうしを比較するとあまり重ならなかったりするようです。UTRにもつ遺伝子を検索すればよいと思います。(統合遺伝子検索GGRNAの応用:miRNAとseedマッチする遺伝子の探索)標的予測プログラムが当たらない理由のひとつは、標的RNAの2次構造やRNA結合タンパクの存在がプログラムでは考慮されていないからかもしれません。Decoy等で阻害したときに変動する遺伝子を取ってしまったほうが早いかもしれません。♦♦515●4●9●22早速のお返事ありがとうございます。論文二つチェックさせていただきます。gatapishi情報、大変参考になりました。お礼が遅くなり大変失礼致します。♦1私もちょうど調査中ですが、たまたま今見ていた論文にあったリファレンスですので、自分で試したわけではないですが...。D他にもあると思いますが取り急ぎ。他に詳しい方がおられたら私も使用感や比較の感触など知りたいです。回答とコメントただいまベータテスト運用中です。そのために通知無くコンテンツの変更やサービスの停止変更されることがあります。質問するならライフサイエンスQA。