フナクイムシは海に棲息する二枚貝で、木材などに食い込んで蜂の巣のように侵食する。出土したことで、縄文海進の存在が確かめられた。ランドサット(地球観測衛星)に見る奥東京湾と寿能泥炭層遺跡の位置(中央上寄りの○印)。縄文時代前期の海岸線(約5,500年前)。縄文時代後期の海岸線(約3,500年前)。館内には、旧石器時代から現代にいたるまでの地層年代史パネルが展示される。埼玉県東部低地帯が奥東京湾になっていた頃の砂浜)が示されている。