ストーリー17歳次期当主、神と人をつなぐため修行中!加賀百々かがももは一見、神社でアルバイトをしている普通の女子高生だが、実は人々と神をつなぐ「在巫女ざいみこ」見習いだ。実家を出て稲荷の神使しんし・香佑焔こうえんと修行に励んでいる。ある日、百々は同級生から相談された怪事件を初めて解決するが、ホッとする間もなく、現当主で実の曾祖母である一子いちこに本家に呼ばれ、「今後なにかあったら頼るように」と生活安全課の東雲天空しののめそらを紹介される。寡黙で無骨な東雲に百々は戸惑いつつも、二人で事件に立ち向かっていくことに——。