FAQをチェックしましょう。ユーザーOrthologの推定に役立つソフトは?0バクテリアの株間のオーソログを推定したいと思っています。NCBIにゲノム配列が公開されている20株に、手持ちの40株を加えて、60株間でのオーソログを探す予定です。手持ち40株は全ゲノム配列はわかっていませんが、部分配列から90%程度の数をカバーする遺伝子を推定してあります。Hitのものをオーソログとみなすフリーソフトを使って推定するなどの方法を考えています。フリーソフトとしては、DomClustやOrthoMCLを調べています。(OrthoMCLは真核生物用なのでしょうか?調べた論文ではバクテリアの遺伝子に対して使っていましたが)オーソログの推定に関して、お勧めの方法やソフトがありましたら、ご紹介ください。回答とコメントただいまベータテスト運用中です。そのために通知無くコンテンツの変更やサービスの停止変更されることがあります。質問するならライフサイエンスQA。