延暦7年(788)伝教大師が比叡山に始めて鎮護国家の道場として建立されたのが根本中堂のはじまりで比叡山の総本堂です。現在の建物は寛永19(1642)年徳川家光公により再建された比叡山様式の特色あるお堂でご本尊は伝教大師御自作の秘仏薬師如来を祭り内陣では国家安泰と国民の反映を祈って護摩が修せられ宝前には有名な不滅の放蕩が輝く続けております。僧侶が学問研究のために議論する道場である。ことに古来比叡山の行事慈恵大師以来5年目毎に行われる法華大会の広学堅義は僧侶になる登竜門として現在に続いている。弥勒両菩薩が祀られ、年に一度授戒会が行われる。