吉本興業の歩みは、1990年代も続きます。吉本興業も例外なく低迷をしました。色々な試みをしながら、前進を止めることはありませんでした。東京を拠点にして活動できるように組織を拡大していきます。大元の大阪本社の芸人さんも、東京芸人の勢いに負けることなく活動を続けています。芸人がネタをやる場所として、NGKのほかに「うめだ花月」という劇場がありましたが、客席数が少ないなどの諸事情があり、客席500を誇る「京橋花月」に移転し、2008年にオープンしました。吉本興業直営の劇場も次々にできて、芸人さんたちの活動の場所を確保しています。2011年には、NSC沖縄が開校することになりました。留まるところがないといえるでしょう。