不死身のチアリーダー、クレア・ベネットがカメラの前で自身の能力を披露し、能力者の存在が世界中に知られてから5年。世界各地から能力者と人間がテキサス州オデッサに集まり、共存を目指す平和サミットが開かれるが、大規模な爆破が起きて多くの死者を出す。それを境に危険分子として登録を義務化され、敵視されるようになった能力者たちは、身を潜めて暮らすように。そのテロでクレアを失ったノア・ベネットは、名前も変えて別人のように生きていたが、ある日、自分を尾行する男と接触したことから自分の記憶が欠落していることに気づく。オデッサの事件の真相と、背後にうごめく巨大な陰謀。女性宇宙飛行士のモリー・ウッズは、宇宙ステーションでの13日間にも及んだ単独ミッションを終え、無事に家族のもとへ帰還。地球へと戻った彼女はなぜか、妊娠していることが発覚する。夫のジョンは、人間と同じ特性を持ったアンドロイドの開発に成功するも、彼の研究を日本人大富豪のヤスモトが虎視眈々と狙っているのだった...。不死身の力を持つチアリーダー、クレア・ベネット、飛行能力を持った議員候補のネイサン・ペトレリ、時空間移動ができるサラリーマン、ヒロ・ナカムラ、人の心を読むことができる警察官マット・パークマン、そして、他人の力をコピーできるピーター・ペトレリ。彼らはすべての力を手にしようとする凶悪な能力者サイラーから世界を救おうとするのだった...。