少女ボーとその両親が乗った乗用車が何者かに襲われ、両親は殺され、ボーは連れ去られて闇に消えていく。これと平行して、ある刑務所では冤罪で死刑を宣告された青年テイトに謎の男が救いの手を差し伸べ、自由と引き換えに少女ボーの命を死守せよという使命を与える。ボーの成長とともに強力になる超能力を狙って、二人に追い迫る政府の悪者たち。世界各地に突如現れた巨大な宇宙船の出現で、地球はパニックとなる。その宇宙船V(ビジター)の指導者アナは怯える人類に対し、平和と友好、そして最新技術や医療の提供を約束。彼らに人類は多大な期待と信頼を寄せるようになるが、実は彼らにはある陰謀があるのだった。FBIの対テロ戦略部の捜査官エリカは相棒のデールと共にテロ組織のアジトに乗り込み、そこで死体と共に発見した情報を元に“ある集会”に乗り込む。そこはVの壊滅を計画するレジスタンスの集会だった。そこでエリカはジャックや、Vの一員でありながら脱出し、Vに反旗を翻したライアンなどと出会う。人類の未来はいかに...。敏腕弁護士パティ・ヒューズと彼女に運命を狂わされてゆく新米弁護士エレンを軸に、難解な訴訟事件とそこからあぶり出される社会の暗部を斬新なフラッシュバックを取り入れ描く。『スター・トレック』の第5番目にあたるシリーズ。異星人(バルカン人)と接触を持つという画期的な出来事から100年近くが経った22世紀。バルカン人は人類を未熟な文明とし、宇宙へ乗り出すことを反対。地球軌道上での宇宙船開発は続けられており、ついに最高速度ワープ5の宇宙船エンタープライズNX-01が完成、バルカン人の反対を押し切り宇宙への初航海が行われることになる。