法における溶質と考えればよい。個しか存在しないので、前節の「溶質の濃度が無限小」という仮定を満たす。節で説明した真空中で試料から直接働く力と、液体分子に媒介される力の合計となる。積られる[Koga1997]。法計算の実際-使用の手引-ここでは純水中でカーボンナノチューブを探針として、試料であるグラフェンシートに近付けたときのフォースカーブ計算を例に使用法を紹介する。この計算ではグラフェンシートの周囲に形成される水和構造を反映したフォースカーブの振動的振舞いをシミュレートすることができる。以下の手順で計算を実行する。起動する1プロジェクトファイルを作成する。name"の欄に適当なプロジェクトファイル名を入力。シミュレータ選択ボックスから[CG]および[Calculation]を選択する。ボックスから[cgafm_fz.csv]を選択する分子構造ファイルはインストールフォルダ内の、[data¥]以下のフォルダに用意されている。Files¥SpmSimurator¥]なら、[C:¥ProgramFiles¥SpmSimulator¥data¥]となる。[data¥Sample¥Surface¥CGMDsurface¥]の直下に配置される。構造は探針の移動に従って常にその配置での安定構造に移行しているとみなして計算を行っている。動方程式に従って計算するほうがより現実に即しているだろう。このように原子の運動を直接扱うことにより、温度の効果を含めることができる。)2ridtである。)mi常微分方程式の数値解法アルゴリズムはいくつか存在するが、本シミュレータでは古典分子動力学法で一般的に用いられている速度ベルレ法をベースとしている。フェムト秒程度の値を入力することになる。