「人々は聖なる沈黙の中で歴史を学ぶ」250年前、【アル・ニエンテ】の災いにより、世界のほとんどが色と音を失った。【ノタリウム】という過去の人々が作り出したエネルギー濃縮体だけが色と音を戻せる。現代の技術では、未だこの人工物質を精製する方法は見つかっていない。そのため、今の世界を保ちながら元の姿を取り戻すには、世界中に残されている【ノタリウム】を再利用するしかない。活発な少年『リツモ』と天才少女『フィシカ』、そして彼女から託された【ノタリウム調律装置】。