時崎狂三の力を借りても折紙を始めとした、愛する者達を守れなかった士道は廃墟と化した天宮市で途方に暮れていた。その時、目の前に神秘的な穴が出現し、自分を呼ぶ声が聞こえた。これは、五河士道がもう一度愛する者を救う為にタイムパトローラーとして運命と戦う知られざる物語。ある日、男の精霊となった湖白信弥。彼の存在は、彼の周囲をも巻き込んで徐々に世界へ波紋を広げていく。本来なら起こりえなかった場所で精霊に遭遇した五河士道。精霊である少女の話を聞いた士道は、彼女を救おうと決意する。これは存在しなかった者と、すでに存在していた者達による物語。