副作用についても、電気鍼治療グループと偽電気鍼治療グループの方が他の2つのグループより少ないという結果でした。偽電気鍼治療グループは副作用が少なくて、1人が眠気を訴えただけでした。副作用を訴える人が8人もいました。被験者数が物足りないために確定的なことは言えませんが、偽電気鍼治療よりも電気鍼治療の方が効果が25%高かったことから鍼治療には本当の効果があるのかもしれません。ある分子の血中濃度を増やす作用のあることが示されています。偽鍼治療と鍼治療とでは脳に及ぼす作用が異なることを示す研究も複数存在します。